转换颜色比例,但与ggplot2保持一个很好的传奇

时间:2012-08-29 21:32:03

标签: r ggplot2

我已经看到了类似的问题,但我想直接问我的具体问题:

我有一个散点图,其中“z”变量编码为色标:

library(ggplot2)
myData <- data.frame(x = rnorm(1000),
                     y = rnorm(1000))
myData$z <- with(myData, x * y)

badVersion <- ggplot(myData,
              aes(x = x, y = y, colour = z))
badVersion <- badVersion + geom_point()
print(badVersion)

产生这个:bad version

正如您所看到的,由于“z”变量是正态分布的,因此很少有点用分布的“极端”颜色着色。这是应该的,但我有兴趣强调差异。一种方法是使用:

betterVersion <- ggplot(myData,
                        aes(x = x, y = y, colour = rank(z)))
betterVersion <- betterVersion + geom_point()
print(betterVersion)

产生这个:better version

通过将rank()应用于“z”变量,我更加强调“z”变量中的微小差异。可以想象在这里使用任何转换,而不是排名,但你明白了。

我的问题基本上是,以最简单的方式,或者最“真正的ggplot2”方式,以原始单位(z的单位,而不是z的等级)获得图例,同时保持改造后的彩色点?

我有一种感觉,它以某种方式使用rescaler(),但我不清楚如何使用rescaler()进行任意转换等。一般来说,更明确的例子会很有用。

提前感谢您的时间。

1 个答案:

答案 0 :(得分:8)

查看包scales 特别 ?trans

我认为,考虑到获得价值或更极端的概率,映射颜色的转换应该是合理的(基本上pnorm(z)

我认为scale_colour_continuous(trans = probability_trans(distribution = 'norm')应该有用,但它会引发警告。

所以我定义了一个新的转换(参见?trans_new

我必须定义转换和逆转

library(scales)
norm_trans <- function(){
  trans_new('norm', function(x) pnorm(x), function(x) qnorm(x))
}

badVersion + geom_point() + scale_colour_continuous(trans = 'norm'))

enter image description here

使用提供的probability_trans会发出警告,似乎无法正常工作

# this throws a warning
badVersion + geom_point+
  scale_colour_continuous(trans = probability_trans(distribution = 'norm'))

## Warning message:
## In qfun(x, ...) : NaNs produced

enter image description here