我正在Java EE 6平台上开发一个企业应用程序。 IDE是NetBeans 7.2，应用程序服务器是GlassFish 3.1.2.2。
业务逻辑必须使用库（特定于HBase-RDF）来处理其核心中的某些任务。最初的HBase-RDF代码依赖于许多软件包，我相信它们的新版本已经被Glassfish使用。例如，我可以看到jar文件中已经包含javax.xml，javax.activation，com.sun.jersey和类似的包。
虽然我以前开发过不那么简单的Java EE应用程序，但我遇到了无数令人头痛的问题，开发应用程序可能与此有关，也可能与此无关。根据我在网上看到的内容，包括几十个stackoverflow问题和错误跟踪系统，我想如果我可以将原始库（HBase-RDF）与其所有依赖关系打包，我想我可以摆脱一些令人头疼的问题。整个jar文件并阻止它们直接包含在项目中。
我的第一个问题是，我对问题的原因是否正确？这可能是我的问题的根源吗？我想答案是肯定的，因为我已经通过从类路径中删除JAXB和Xerces jar解决了我的一个问题，幸运的是我必须使用的Hbase-RDF的那些部分不会使用它们。
第二个问题是，如果我对前一个问题是正确的，我该怎么做？如何限制这些库仅由一个库（Hbase-RDF）使用？
注意：说构建过程没有任何问题可能很有用，但我面临部署和运行项目的两个主要问题。首先，应用程序在我的本地Glassfish实例上成功部署，该实例与netbeans一起安装，但是相同的.ear包无法在另一个相同版本的实例上部署，而server.log文件不包含任何有助于查找问题原因的内容。该错误与this非常相似，但建议的解决方案不起作用。第二个问题与this非常相似，而且我已经尝试了所有提出的解决方案而没有运气。有趣的是，Web模块中的Web服务成功调用EJB，但JSF facelet index.html无法运行。
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我不确定您的关注是关于构建过程还是部署
因为对于部署，如果您有一个依赖于您已部署的库的不同版本的库，则无法使用OSGi（不能使用具有相同类加载器的库的两个版本）都无法工作。
您是否尝试过完全删除依赖库并仅使用较新版本
如果您的唯一依赖项是JAXB和xml java包，那么您可能会很幸运