Question

我正在使用d3.js将动物家族（有机体）可视化（一次最多4000个）作为树形图，尽管数据源也可以是目录列表或命名空间对象列表。我的数据如下：

json = {
    organisms:[
        {name: 'Hemiptera.Miridae.Kanakamiris'},
        {name: 'Hemiptera.Miridae.Neophloeobia.incisa'},
        {name: 'Lepidoptera.Nymphalidae.Ephinephile.rawnsleyi'},
        ... etc ...
    ]
}

我的问题是：我正在尝试找到将上述数据转换为分层父/子数据结构的最佳方法，正如许多d3可视化使用的那样，例如treemap（对于数据示例，请参阅d3 / examples / data /目录中的flare.json。以下是所需数据结构的示例：

{"name": "ROOT",
 "children": [
        {"name": "Hemiptera",
         "children": [
             {"name": "Miridae",
              "children": [
                  {"name": "Kanakamiris", "children":[]},
                  {"name": "Neophloeobia",
                   "children": [
                       {"name": "incisa", "children":[] }
                   ]}
              ]}
         ]},
        {"name": "Lepidoptera",
         "children": [
             {"name": "Nymphalidae",
              "children": [
                  {"name": "Ephinephile",
                   "children": [
                       {"name": "rawnsleyi", "children":[] }
                   ]}
              ]}
         ]}
    ]}
}

编辑：在ROOT节点内包含所有原始所需的数据结构，以便符合d3示例的结构，这些示例只有一个主父节点。

我希望了解一般的设计模式，作为奖励，我很乐意在javascript，php，（甚至是python）中看到一些解决方案。 javascript是我的偏好。关于php：我实际使用的数据来自php脚本对数据库的调用，该脚本将结果编码为json。 php脚本中的数据库结果是一个有序数组（见下文），如果这是基于php的答案的任何用途。

Array
(
    [0] => Array
        (
            ['Rank_Order'] => 'Hemiptera'
            ['Rank_Family'] => 'Miridae'
            ['Rank_Genus'] => 'Kanakamiris'
            ['Rank_Species'] => ''
        ) ........

其中： 'Rank_Order' isParentOf 'Rank_Family' isParentOf 'Rank_Genus' isParentOf 'Rank_Species'

我问了一个类似的问题，专注于一个php解决方案here，但唯一的答案是没有在我的服务器上工作，我不太明白发生了什么，所以我想从设计中提出这个问题模式透视，并包括我在javascript和d3.js中的实际使用的参考。

Answer 1

以下内容特定于您提供的结构，可以相当容易地使其更通用。我确信 addChild 功能可以简化。希望这些评论很有用。

function toHeirarchy(obj) {

  // Get the organisms array
  var orgName, orgNames = obj.organisms;

  // Make root object
  var root = {name:'ROOT', children:[]};

  // For each organism, get the name parts
  for (var i=0, iLen=orgNames.length; i<iLen; i++) {
    orgName = orgNames[i].name.split('.');

    // Start from root.children
    children = root.children;

    // For each part of name, get child if already have it
    // or add new object and child if not
    for (var j=0, jLen=orgName.length; j<jLen; j++) {
      children = addChild(children, orgName[j]);      
    }
  }
  return root;

  // Helper function, iterates over children looking for 
  // name. If found, returns its child array, otherwise adds a new
  // child object and child array and returns it.
  function addChild(children, name) {

    // Look for name in children
    for (var i=0, iLen=children.length; i<iLen; i++) {

      // If find name, return its child array
      if (children[i].name == name) {
        return children[i].children;        
      }
    }
    // If didn't find name, add a new object and 
    // return its child array
    children.push({'name': name, 'children':[]});
    return children[children.length - 1].children;
  }
}

Answer 2

鉴于您的开始输入，我相信类似下面的代码将产生您想要的输出。我不认为这是最漂亮的方式，但这是当时想到的。

对数据进行预处理似乎最容易，首先将初始字符串数组拆分为数组数组，如下所示：

[
   ["Hemiptera","Miridae","Kanakamiris" ],
   ["Hemiptera","Miridae","Neophloeobia","incisa" ],
   //etc
]

...然后处理以获得如下形式的工作对象：

  working = {
       Hemiptera : {
           Miridae : {
              Kanakamiris : {},
              Neophloeobia : {
                  incisa : {}
              }
           }
       },
       Lepidoptera : {
           Nymphalidae : {
              Ephinephile : {
                  rawnsleyi : {}
              }
           }
       }
    }

...因为使用对象而不是数组可以更容易地测试子项是否已经存在。创建了上述结构后，我最后一次处理它以获得最终所需的输出。所以：

// start by remapping the data to an array of arrays
var organisms = data.organisms.map(function(v) {
        return v.name.split(".");
    });

// this function recursively processes the above array of arrays
// to create an object whose properties are also objects
function addToHeirarchy(val, level, heirarchy) {
    if (val[level]) {
        if (!heirarchy.hasOwnProperty(val[level]))
            heirarchy[val[level]] = {};
        addToHeirarchy(val, level + 1, heirarchy[val[level]]);
    }
}
var working = {};    
for (var i = 0; i < organisms.length; i++)
    addToHeirarchy(organisms[i], 0, working);

// this function recursively processes the object created above
// to create the desired final structure
function remapHeirarchy(item) {
    var children = [];
    for (var k in item) {
        children.push({
            "name" : k,
            "children" : remapHeirarchy(item[k])
        });
    }
    return children;
}

var heirarchy = {
    "name" : "ROOT",
    "children" : remapHeirarchy(working)
};

演示：http://jsfiddle.net/a669F/1/

Answer 3

我自己的问题的替代答案....在过去的一天里，我已经学习了很多关于d3.js以及与{。3}}和.key（）和.entries相关的问题（）是我的朋友（所有d3功能）。这个答案涉及更改初始数据，因此它可能不符合我提出的具体问题的良好答案。但是，如果某人有类似的问题并且可以在服务器上进行更改，那么这是一个非常简单的解决方案：

以这种格式从数据库中返回数据：

json = {'Organisms': [
    { 'Rank_Order': 'Hemiptera',
      'Rank_Family': 'Miridae',
      'Rank_Genus': 'Kanakamiris',
      'Rank_Species': '' },
    {}, ...
]}

然后使用d3.nest()

organismNest = d3.nest()
    .key(function(d){return d.Rank_Order;})
    .key(function(d){return d.Rank_Family;})
    .key(function(d){return d.Rank_Genus;})
    .key(function(d){return d.Rank_Species;})
    .entries(json.Organism);

返回：

{
key: "Hemiptera"
  values: [
    {
      key: "Cicadidae"
      values: [
        {
          key: "Pauropsalta "
          values: [
            {
              key: "siccanus"
              values: [
                       Rank_Family: "Cicadidae"
                       Rank_Genus: "Pauropsalta "
                       Rank_Order: "Hemiptera"
                       Rank_Species: "siccanus"
                       AnotherOriginalDataKey: "original data value"

etc etc, nested and lovely

这返回的内容非常类似于我在问题中描述为我想要的格式的数组，但有一些区别。特别是，没有所有封闭的ROOT元素，而且我最初想要的键是“name”和“children”.nest（）分别将键作为“key”和“values”返回。通过定义适当的数据访问器功能（基本d3概念），这些备选键很容易在d3.js中使用......但这超出了问题的原始范围...希望对某人也有帮助

如何在JSON中将此数据编码为父/子结构

3 个答案: