通过索引在矩阵中指定值

时间:2012-08-24 10:03:39

标签: python arrays r numpy rpy2

来自R的

我习惯于为矩阵分配一个简单的值 通过使用索引如:

> mat <- matrix(NA,2,3)
> mat
     [,1] [,2] [,3]
[1,]   NA   NA   NA
[2,]   NA   NA   NA
> mat[1,2] <- 12
> mat
     [,1] [,2] [,3]
[1,]   NA   12   NA
[2,]   NA   NA   NA
> 

现在我必须在Python中运行一些脚本并想要收集 二维矩阵中的值也是如此。矩阵应该有列和rownames 我也希望通过索引访问它们。 到目前为止,我想到了两种方式:

  • 要么使用RPy,要么像我习惯在R中那样做, 虽然我不知道索引命令如何与RPy一起使用。

像:

import rpy2.robjects as robjects

names = ['A','B','C']
dimnames = robjects.r['list'](names,names) 
mat = robjects.r['matrix'](NA, nrow = len(names), ncol=len(names), dimnames = dimnames)

# and here how to index and assign e.g. the value 12 to the cell mat["A","B"]??
  • 或使用Python本机NumPy阵列,这可能是一个更清洁的解决方案。目前我只是不知道如何使用名称列表创建矩阵/数组,以及如何使用索引为之分配值。

有什么建议吗?

谢谢!

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

我认为DataFrame datatype from pandas可能适合你。

import pandas
matrix = pandas.DataFrame(index=['a','b','c'], columns=['one','two'])

返回

   one  two
a  NaN  NaN
b  NaN  NaN
c  NaN  NaN

您可以更改条目:matrix['one']['a']=1,以及其他熟悉的numpy操作(如above link中所述)。

答案 1 :(得分:0)

您可以使用字典将行/列名称映射到索引。

names = ['A', 'B', 'C']
idx = range(0, len(names))
d = dict((key, value) for (key, value) in zip(names, idx))

然后用它来访问矩阵中的元素

mat[d['A'], d['B']] = 12

rpy2的文件所述,这应该有用;如果没有, 也许以下语法更合适:

mat.rx(d('A'), d('B'))