如何确保R / Rcpp代码可重现（“可分发”）？

Question

我为论文编写了一些R代码，依赖于一些外部包（例如plyr和reshape）并使用inline编写了几个相对简单的内联C ++函数， RcppArmadillo。

我希望确保它可以在我自己（Win64）以外的计算机上“按原样”执行，以用于研究再现性目的。

我的问题：假设我包含了安装所需软件包的代码，RcppArmadillo（和Rcpp和inline）软件包是否足以能够编译{ {1}}，或者最终用户是否需要在Windows机器上更改系统路径以进行编译？如果没有，是否可以/建议从我的结尾保存已编译的功能并包含在我发货的R代码中？

此外，在不太可能的情况下，代码应该在一段时间后运行（比如说，几年），是否足够包含完整的R安装以及当前版本中的相关软件包以使代码“未来” -proof“？

我希望问题很明确。

Answer 1

我认为你的意思是你的代码是“可分发的”和“可由其他人执行”，这是一个更宽松的要求。 “可重复”意味着前一个问题是正确的，并且增加了结果相同的限制（直到你选择的epsilon）。

“我怎样才能让其他人运行我的R代码”的常用答案是创建一个包。

对于与Rcpp相关的代码，我们有一个完整的小插图致力于使用您的Rcpp-using cod构建自己的包。插图被称为'Rcpp-package'。