即使允许NA，R函数prcomp也会以NA的值失败

Question

我使用函数prcomp来计算前两个主要组件。但是，我的数据有一些NA值，因此函数会抛出错误。即使在帮助文件?prcomp

中提到，定义的na.action似乎也不起作用

以下是我的例子：

d <- data.frame(V1 = sample(1:100, 10), V2 = sample(1:100, 10))

prcomp(d, center = TRUE, scale = TRUE, na.action = na.omit)

d$V1[5] <- NA
d$V2[7] <- NA

prcomp(d, center = TRUE, scale = TRUE, na.action = na.omit)

我正在使用适用于Mac OS X的最新R版本2.15.1。

prcomp失败时，有人能看到原因吗？

这是我的新例子：

d <- data.frame(V1 = sample(1:100, 10), V2 = sample(1:100, 10))

result <- prcomp(d, center = TRUE, scale = TRUE, na.action = na.omit)

result$x

d$V1[5] <- NA

result <- prcomp(~V1+V2, data=d, center = TRUE, scale = TRUE, na.action = na.omit)

result$x

是否可以在PC1和PC2中保留第5行？在我的真实数据集中，我当然有两列以上的变量，只有一些变量丢失了，我不想丢失隐藏在其他值中的剩余信息！

Answer 1

是的，除非您使用na.action界面，否则formula被完全忽略似乎是一个“功能”（错误）。这是brought up before on the R Development list。

我认为这应记录在案或标记为错误。

为了清楚起见，这会有效，因为它可以访问公式界面：

prcomp(~V1+V2, data=d, center = TRUE, scale = TRUE, na.action = na.omit)

Answer 2

如果您不愿意使用公式界面，另一种解决方案是

prcomp(na.omit(d), center = TRUE, scale = TRUE)

包括将na.omit直接应用于数据框。