我有一个从EBI metagenomes下载的项目数据库。这些是包含序列读取的fasta文件，并且经历了基本处理（重复屏蔽，长度截止 - 100等）我想从这里提取16s读取的序列。有人知道有这个功能的好工具吗？ 谢谢你的帮助！
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我们（EBI宏基因组学）将很快发布一个新功能，所以如果你可以等待，将有一个选项下载与16S基因模型匹配的序列。我们还打算根据这些序列提供分类树。选择16S读数将使用rRNASelector进行，rRNASelector是一个开源软件工具，您可以在互联网上找到。希望有助于并密切关注EBI宏基因组学（https://www.ebi.ac.uk/metagenomics）。 感谢。
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您可以使用我们的工具C16S（由Biosciences R＆amp; D，TCS Innovation Labs开发）。
C16S：16S rDNA分类算法，使用属特异性隐马尔可夫模型（HMM）进行16S rDNA序列的分类分类。为了获得高水平的准确性，C16S分类器包含一系列步骤，这些步骤试图通过考虑HMM比对的质量来改进16S rDNA片段的最终分配。