Question

我有以下小脚本 - myjob.qsub：

#!/bin/sh -login
#PBS -l walltime=00:15:00
#PBS -l nodes=1:ppn=1
#PBS -l mem=2gb 
#PBS -N myrun05168
/myexecutable >mylog.log

我确实通过以下方式使其可执行：

chmod u+x myexecutable

当我尝试通过将目录更改为可执行文件夹来运行时，然后对该作业进行总结：

qsub myjob.qsub

给出了no / myexecutable文件或目录的错误。

我尝试使用“./”：

     #!/bin/sh -login
     #PBS -l walltime=00:15:00
      #PBS -l nodes=1:ppn=1
      #PBS -l mem=2gb 
     #PBS -N myrun05168
    ./myexecutable >mylog.log

但没有帮助。

当我试图在命令行中运行我的可执行文件时，它可以工作：

./myexecutable

由于我无法运行此作业，因此需要将此作业作为群集计算机中的作业提交。

有什么建议吗？

Answer 1

你需要提供脚本的完整路径，我假设脚本实际上不在你的根目录中，也许它应该是/ home / username / myexecutable

Answer 2

您的脚本是否使用-login运行，是否需要？

您应该更改脚本以使用相对路径名，例如

myruns/p_runs/Fw2010/seed1/myexecutable >mylog.log

在unix中运行一份工作

2 个答案: