提取大矩阵的非对角切片

时间:2012-08-01 12:42:14

标签: r matrix slice diagonal

我有一个很大的nxn矩阵,想要拍摄不同大小的非对角切片。例如:

1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6
1 2 3 4 5 6

我想要一个R函数,当给定矩阵和“对角线切片的宽度”时,它将返回仅具有这些值的nxn矩阵。所以对于上面的矩阵,比方说3,我得到:

1 x x x x x
1 2 x x x x
1 2 3 x x x
x 2 3 4 x x
x x 3 4 5 x
x x x 4 5 6

目前我正在使用(原谅我)一个非常缓慢的for循环:

getDiags<-function(ndiags, cormat){
  resmat=matrix(ncol=ncol(cormat),nrow=nrow(cormat))
  dimnames(resmat)<-dimnames(cormat)
  for(j in 1:ndiags){
    resmat[row(resmat) == col(resmat) + j] <- 
      cormat[row(cormat) == col(cormat) + j]
  }
  return(resmat)
}

我意识到这是解决这个问题的非常“非R”方式。有没有更好的方法,可能使用diag或lower.tri?

3 个答案:

答案 0 :(得分:13)

size <- 6
mat <- matrix(seq_len(size ^ 2), ncol = size)


low <- 0
high <- 3

delta <- rep(seq_len(ncol(mat)), nrow(mat)) - 
    rep(seq_len(nrow(mat)), each = ncol(mat))
#or Ben Bolker's better alternative
delta <- row(mat) - col(mat)
mat[delta < low | delta > high] <- NA
mat

这适用于我机器上的5000 x 5000矩阵

答案 1 :(得分:0)

如果您想使用upper.trilower.tri,您可以编写以下函数:

cormat <- mapply(rep, 1:6, 6)

u.diags <- function(X, n) {
  X[n:nrow(X),][lower.tri(X[n:nrow(X),])] <- NA
  return(X)
}

l.diags <- function(X, n) {
  X[,n:ncol(X)][upper.tri(X[,n:ncol(X)])] <- NA
  return(X)
}

n.diags <- function(X, n.u, n.l) {
  X[n.u:nrow(X),][lower.tri(X[n.u:nrow(X),])] <- NA
  X[,n.l:ncol(X)][upper.tri(X[,n.l:ncol(X)])] <- NA
  return(X)
}

l.diags(cormat, 3)
u.diags(cormat, 3)
n.diags(cormat, 3, 1)

答案 2 :(得分:0)

您可以这样做:

矩阵:

m<-
matrix(1:6,ncol = 6, nrow=6 ,byrow = T)

功能

n_diag <- function (x, n) {
    d <- dim(x)
    ndiag <- .row(d) - n >= .col(d)
    x[upper.tri(x) | ndiag] <- NA
    return(x)
}

通话:

n_diag(m,3)

#     [,1] [,2] [,3] [,4] [,5] [,6]
#[1,]    1   NA   NA   NA   NA   NA
#[2,]    1    2   NA   NA   NA   NA
#[3,]    1    2    3   NA   NA   NA
#[4,]   NA    2    3    4   NA   NA
#[5,]   NA   NA    3    4    5   NA
#[6,]   NA   NA   NA    4    5    6

只是为了好玩:

#lapply(1:6, n_diag, x = m)