我需要从php运行python脚本

Question

我必须使用PHP为使用python编写的软件设计一个接口。目前该软件通过传递输入从命令行使用，大多数输入是文本文件。有一系列步骤，每个步骤都会调用一个python脚本。每个步骤都将文本文件作为输入，并在用户决定的文件夹中生成输出文本文件。我正在使用php的system()，但我看不到输出，但是当我从命令行使用相同的命令时，它会生成输出。命令示例：
python /software/qiime-1.4.0-release/bin/check_id_map.py -m /home/qiime/sample/Fasting_Map.txt -o /home/qiime/sample/mapping_output -v

Answer 1

如果您不在Windows上，是否尝试将2>&1（将stderr重定向到stdout）添加到命令的末尾？

$output = system("python /software/qiime-1.4.0-release/bin/check_id_map.py -m /home/qiime/sample/Fasting_Map.txt -o /home/qiime/sample/mapping_output -v 2>&1", $exitcode);

从http://www.php.net/manual/en/function.system.php#108713

找到

此外，医生说它

  

成功时返回命令输出的最后一行，并返回FALSE   故障。

因此，如果您尝试获取多行，则可能需要将其重定向到文件并将其读入。

Answer 2

试试这个

$script = 'software/qiime-1.4.0-release/bin/check_id_map.py -m /home/qiime/sample/Fasting_Map.txt -o /home/qiime/sample/mapping_output -v';
$a = exec($script);

Answer 3

而不是system()尝试围绕`ticks` ...

中的代码

它具有类似的功能，但在返回输出的方式上表现略有不同。