有没有人有经验分析Python / SQLAlchemy应用程序?找到瓶颈和设计缺陷的最佳方法是什么?
我们有一个Python应用程序,其中数据库层由SQLAlchemy处理。该应用程序使用批处理设计,因此许多数据库请求按顺序在有限的时间内完成。目前运行时间太长,因此需要进行一些优化。我们不使用ORM功能,数据库是PostgreSQL。
答案 0 :(得分:68)
有时只是简单的SQL日志记录(通过python的日志记录模块启用或通过echo=True
上的create_engine()
参数)可以让您了解事情需要多长时间。例如,如果您在SQL操作之后立即记录某些内容,则会在日志中看到类似的内容:
17:37:48,325 INFO [sqlalchemy.engine.base.Engine.0x...048c] SELECT ...
17:37:48,326 INFO [sqlalchemy.engine.base.Engine.0x...048c] {<params>}
17:37:48,660 DEBUG [myapp.somemessage]
如果你在操作后立即记录myapp.somemessage
,你就知道完成SQL部分需要334ms。
记录SQL还将说明是否发布了数十个/数百个查询,这些查询可以通过连接更好地组织成更少的查询。使用SQLAlchemy ORM时,部分(contains_eager()
)或完全(eagerload()
,eagerload_all()
)提供“急切加载”功能可自动执行此活动,但没有ORM,它只是意味着使用连接,以便可以在一个结果集中加载多个表中的结果,而不是在添加更多深度时将查询数相乘(即r + r*r2 + r*r2*r3
...)
如果日志记录显示单个查询花费的时间过长,则需要分析处理查询的数据库花费的时间,通过网络发送结果,由DBAPI处理,最后由SQLAlchemy的结果集和/或ORM层。根据具体情况,每个阶段都可能出现各自的瓶颈。
为此您需要使用分析,例如cProfile或hotshot。这是我使用的装饰者:
import cProfile as profiler
import gc, pstats, time
def profile(fn):
def wrapper(*args, **kw):
elapsed, stat_loader, result = _profile("foo.txt", fn, *args, **kw)
stats = stat_loader()
stats.sort_stats('cumulative')
stats.print_stats()
# uncomment this to see who's calling what
# stats.print_callers()
return result
return wrapper
def _profile(filename, fn, *args, **kw):
load_stats = lambda: pstats.Stats(filename)
gc.collect()
began = time.time()
profiler.runctx('result = fn(*args, **kw)', globals(), locals(),
filename=filename)
ended = time.time()
return ended - began, load_stats, locals()['result']
要分析代码的一部分,请将其放在装饰器的函数中:
@profile
def go():
return Session.query(FooClass).filter(FooClass.somevalue==8).all()
myfoos = go()
分析的输出可用于了解时间花费的时间。例如,如果您在cursor.execute()
内看到所有时间,那就是对数据库的低级DBAPI调用,这意味着您的查询应该通过添加索引或重构查询和/或底层架构进行优化。对于该任务,我建议使用pgadmin及其图形EXPLAIN实用程序来查看查询正在执行的工作类型。
如果您看到数千个与获取行相关的调用,则可能意味着您的查询返回的行数超出预期 - 由于连接不完整而导致的笛卡尔积可能导致此问题。另一个问题是在类型处理中花费的时间 - 像Unicode
这样的SQLAlchemy类型将对绑定参数和结果列执行字符串编码/解码,这在所有情况下都可能不需要。
配置文件的输出可能有点令人生畏,但经过一些练习后,它们很容易阅读。曾经有人在邮件列表上声称速度缓慢,在让他发布了配置文件的结果之后,我能够证明速度问题是由于网络延迟 - 在cursor.execute()以及所有Python中花费的时间方法非常快,而大部分时间花在了socket.receive()上。
如果你感到雄心勃勃,那么在SQLAlchemy单元测试中还有一个更复杂的SQLAlchemy概要分析示例,如果你在http://www.sqlalchemy.org/trac/browser/sqlalchemy/trunk/test/aaa_profiling。在那里,我们使用装饰器进行测试,该装饰器断言用于特定操作的最大数量的方法调用,因此如果检查了一些低效的函数,测试将揭示它(重要的是要注意在Python中,函数调用具有最高的任何操作的开销,以及调用次数通常与花费的时间几乎成比例)。值得注意的是“zoomark”测试使用了一种奇特的“SQL捕获”方案,该方案从等式中减少了DBAPI的开销 - 尽管这种技术对于花园种类分析并不是必需的。
答案 1 :(得分:42)
经过一些小修改,
from sqlalchemy import event
from sqlalchemy.engine import Engine
import time
import logging
logging.basicConfig()
logger = logging.getLogger("myapp.sqltime")
logger.setLevel(logging.DEBUG)
@event.listens_for(Engine, "before_cursor_execute")
def before_cursor_execute(conn, cursor, statement,
parameters, context, executemany):
context._query_start_time = time.time()
logger.debug("Start Query:\n%s" % statement)
# Modification for StackOverflow answer:
# Show parameters, which might be too verbose, depending on usage..
logger.debug("Parameters:\n%r" % (parameters,))
@event.listens_for(Engine, "after_cursor_execute")
def after_cursor_execute(conn, cursor, statement,
parameters, context, executemany):
total = time.time() - context._query_start_time
logger.debug("Query Complete!")
# Modification for StackOverflow: times in milliseconds
logger.debug("Total Time: %.02fms" % (total*1000))
if __name__ == '__main__':
from sqlalchemy import *
engine = create_engine('sqlite://')
m1 = MetaData(engine)
t1 = Table("sometable", m1,
Column("id", Integer, primary_key=True),
Column("data", String(255), nullable=False),
)
conn = engine.connect()
m1.create_all(conn)
conn.execute(
t1.insert(),
[{"data":"entry %d" % x} for x in xrange(100000)]
)
conn.execute(
t1.select().where(t1.c.data.between("entry 25", "entry 7800")).order_by(desc(t1.c.data))
)
输出类似于:
DEBUG:myapp.sqltime:Start Query:
SELECT sometable.id, sometable.data
FROM sometable
WHERE sometable.data BETWEEN ? AND ? ORDER BY sometable.data DESC
DEBUG:myapp.sqltime:Parameters:
('entry 25', 'entry 7800')
DEBUG:myapp.sqltime:Query Complete!
DEBUG:myapp.sqltime:Total Time: 410.46ms
然后,如果你发现一个奇怪的慢查询,你可以采取查询字符串,格式参数(可以完成%
字符串格式化运算符,至少为psycopg2),前缀为“EXPLAIN ANALYZE” “并将查询计划输出推送到http://explain.depesz.com/(通过this good article on PostgreSQL performance找到)
答案 2 :(得分:3)
我在使用cprofile并查看runsnakerun中的结果方面取得了一些成功。这至少告诉了我需要很长时间的功能和调用,以及数据库是否存在问题。 文档是here。你需要wxpython。 presentation就可以帮助您入门 它就像
一样简单import cProfile
command = """foo.run()"""
cProfile.runctx( command, globals(), locals(), filename="output.profile" )
然后
python runsnake.py output.profile
如果您希望优化查询,则需要postgrsql profiling。
记录查询也值得记录,但是我知道没有解析器来获取长时间运行的查询(并且它对并发请求不会有用)。
sqlhandler = logging.FileHandler("sql.log")
sqllogger = logging.getLogger('sqlalchemy.engine')
sqllogger.setLevel(logging.info)
sqllogger.addHandler(sqlhandler)
并确保您的create engine语句具有echo = True。
当我这样做时,实际上我的代码是主要问题,因此cprofile事情有所帮助。
答案 3 :(得分:0)
我刚刚发现了库sqltap
(https://github.com/inconshreveable/sqltap)。它会生成样式精美的HTML页面,有助于检查和分析由SQLAlchemy生成的SQL查询。
用法示例:
profiler = sqltap.start()
run_some_queries()
statistics = profiler.collect()
sqltap.report(statistics, "report.html")
该库尚未更新两年,但是,当我今天早些时候用我的应用程序对其进行测试时,它似乎运行良好。
答案 4 :(得分:0)
如果您只想分析查询次数,您可以使用上下文管理器记录在特定上下文中执行的所有查询:
"""SQLAlchemy Query profiler and logger."""
import logging
import time
import traceback
import sqlalchemy
class QueryProfiler:
"""Log query duration and SQL as a context manager."""
def __init__(self,
engine: sqlalchemy.engine.Engine,
logger: logging.Logger,
path: str):
"""
Initialize for an engine and logger and filepath.
engine: The sqlalchemy engine for which events should be logged.
You can pass the class `sqlalchemy.engine.Engine` to capture all engines
logger: The logger that should capture the query
path: Only log the stacktrace for files in this path, use `'/'` to log all files
"""
self.engine = engine
self.logger = logger
self.path = path
def _before_cursor_execute(self, conn, cursor, statement, parameters, context, executemany):
"""Set the time on the connection to measure query duration."""
conn._sqla_query_start_time = time.time()
def _after_cursor_execute(self, conn, cursor, statement, parameters, context, executemany):
"""Listen for the 'after_cursor_execute' event and log sqlstatement and time."""
end_time = time.time()
start_time = getattr(conn, '_sqla_query_start_time', end_time)
elapsed_time = round((end_time-start_time) * 1000)
# only include the files in self.path in the stacktrace to reduce the noise
stack = [frame for frame in traceback.extract_stack()[:-1] if frame.filename.startswith(self.path)]
self.logger.debug('Query `%s` took %s ms. Stack: %s', statement, elapsed_time, traceback.format_list(stack))
def __enter__(self, *args, **kwargs):
"""Context manager."""
if isinstance(self.engine, sqlalchemy.engine.Engine):
sqlalchemy.event.listen(self.engine, "before_cursor_execute", self._before_cursor_execute)
sqlalchemy.event.listen(self.engine, "after_cursor_execute", self._after_cursor_execute)
return self
def __exit__(self, *args, **kwargs) -> None:
"""Context manager."""
if isinstance(self.engine, sqlalchemy.engine.Engine):
sqlalchemy.event.remove(self.engine, "before_cursor_execute", self._before_cursor_execute)
sqlalchemy.event.remove(self.engine, "after_cursor_execute", self._after_cursor_execute)
使用和测试:
"""Test SQLAlchemy Query profiler and logger."""
import logging
import os
import sqlalchemy
from .sqlaprofiler import QueryProfiler
def test_sqlite_query(caplog):
"""Create logger and sqllite engine and profile the queries."""
logging.basicConfig()
logger = logging.getLogger(f'{__name__}')
logger.setLevel(logging.DEBUG)
caplog.set_level(logging.DEBUG, logger=f'{__name__}')
path = os.path.dirname(os.path.realpath(__file__))
engine = sqlalchemy.create_engine('sqlite://')
metadata = sqlalchemy.MetaData(engine)
table1 = sqlalchemy.Table(
"sometable", metadata,
sqlalchemy.Column("id", sqlalchemy.Integer, primary_key=True),
sqlalchemy.Column("data", sqlalchemy.String(255), nullable=False),
)
conn = engine.connect()
metadata.create_all(conn)
with QueryProfiler(engine, logger, path):
conn.execute(
table1.insert(),
[{"data": f"entry {i}"} for i in range(100000)]
)
conn.execute(
table1.select()
.where(table1.c.data.between("entry 25", "entry 7800"))
.order_by(sqlalchemy.desc(table1.c.data))
)
assert caplog.messages[0].startswith('Query `INSERT INTO sometable (data) VALUES (?)` took')
assert caplog.messages[1].startswith('Query `SELECT sometable.id, sometable.data \n'
'FROM sometable \n'
'WHERE sometable.data BETWEEN ? AND ? '
'ORDER BY sometable.data DESC` took ')