Question

我的os是debian6，编译安装R后有一个libR.pc

root@debian:/home/tiger# cat /home/tiger/R-2.15.1/lib/pkgconfig/libR.pc  
rhome=/home/tiger/R-2.15.1/lib/R  
rlibdir=${rhome}/lib  
rincludedir=/home/tiger/R-2.15.1/lib/R/include  
Name: libR  
Description: R as a library  
Version: 2.15.1  
Libs: -L${rlibdir} -lR  
Cflags: -I${rincludedir} -I${rincludedir}  
Libs.private:

在/ etc / profile中设置R环境时：
R_HOME = /home/tiger/R-2.15.1
或
R_HOME = /home/tiger/R-2.15.1/lib/R
我会选择在/ etc / profile中写哪一行？

Answer 1

在Debian（或Ubuntu系统等衍生产品）上，您/etc/R/设置R使用的变量：

edd@max:~$ ls -l /etc/R/
total 28
-rw-r--r-- 1 root root  602 Jun 17 20:29 ldpaths
-rw-r--r-- 1 root root 5461 Jun 17 20:29 Makeconf
-rw-r--r-- 1 root root 1868 Mar 31 13:50 Renviron
-rw-r--r-- 1 root root  608 Sep 25  2009 Renviron.site
-rw-r--r-- 1 root root 1159 Mar 31 08:03 repositories
-rw-r--r-- 1 root root  792 Oct 28  2009 Rprofile.site
edd@max:~$

并且R_HOME/etc/中的文件应该是软链接 - 至少如果您使用预构建的二进制文件。如果你构建自己的二进制文件，那就是你的问题。

您引用的文件在Debian / Ubuntu系统上安装为/usr/lib/pkgconfig/libR.pc。设置R_HOME 不，因为R找到了自己的值（请参阅@ flodel的回答）。

Answer 2

在我的系统上：

cat $R_HOME

什么都没有，但在R会话中，我得到了：

> Sys.getenv("R_HOME")
[1] "/usr/lib/R"

这应该告诉你两件事：

{R}启动时设置为R_HOME，因此，除非您确切知道自己在做什么，否则您可能无需在/etc/profile中进行设置。
您可以使用Sys.getenv查找R_HOME。

如何在/ etc / profile中设置R环境？

2 个答案: