Question

我使用this回答中描述的方法成功安装了numpy和scipy。然后我想添加scikit-learn所以首先我尝试将scikit-learn==0.11添加到requirements.txt，当推送到heroku时，我收到一条错误消息：

ImportError: liblapack.so.3gf: cannot open shared object file: No such file or directory

所以我已经LD_LIBRARY_PATH添加了liblapack.so.3gf的路径，但后来我得到了这个：

ImportError: libgfortran.so.3: cannot open shared object file: No such file or directory

我相信heroku没有fortran编译器，但也许我错了。我该如何解决这个问题？

Answer 1

根据这些指示，我刚刚在heroku上完成了scikit-learn的安装。我很高兴看到没有必要获得自定义二进制文件，但设置一些环境可以解决问题：）

你可以在我的wyn buildpack的fork中找到额外的自定义步骤： https://github.com/ToonTimbermont/heroku-buildpack-python

关键是为LD_LIBRARY_PATH设置正确的值： export LD_LIBRARY_PATH=$(pwd)/vendor/lib:$(pwd)/vendor/lib/atlas- base:$(pwd)/vendor/lib/atlas-base/atlas

我还将这些路径添加到heroku配置中： heroku config:add LD_LIBRARY_PATH=/app/.heroku/vendor/lib/atlas-base/atlas:/app/.heroku/vendor/lib/atlas-base:/app/.heroku/vendor/lib/

Answer 2

另一个不错的选择是conda buildpack，它允许您将通过Anaconda / Miniconda提供的任何免费Linux64软件包添加到Heroku应用程序中。一些最受欢迎的软件包包括numpy，scipy，scikit-learn，statsmodels和pandas。虽然buildpack使得向应用程序添加包变得相当简单，但缺点是buildback占用了大量空间，而你必须等待Anaconda更新存储库中的库。

如果您在Heroku上启动一个新的Python应用程序，可以使用以下命令添加conda buildpack：

$ heroku create YOUR_APP_NAME --buildpack https://github.com/kennethreitz/conda-buildpack.git

如果您已经在Heroku上设置了Python应用程序，则可以使用以下命令将conda buildpack添加到现有应用程序：

$ heroku config:add BUILDPACK_URL=https://github.com/kennethreitz/conda-buildpack.git

或者，如果您需要按名称指定应用程序：

$ heroku config:add BUILDPACK_URL=https://github.com/kennethreitz/conda-buildpack.git --app YOUR_APP_NAME

要使用buildpack，您需要在app目录，requirements.txt和conda-requirements.txt中包含两个文本文件。与标准Python buildpack一样，requirements.txt文件列出了应使用pip安装的软件包。应使用conda安装的软件包列在conda-requirements.txt文件中。一些最有用的科学软件包包括numpy，scipy，scikit-learn，statsmodels，pandas和cvxopt。可以在repo.continuum.io找到可用conda包的完整列表。

例如：

$ cat requirements.txt
gunicorn==0.14.2
requests==0.11.1

$ cat conda-requirements.txt
scipy
numpy
cvxopt

就是这样！您现在可以将Anaconda软件包添加到Heroku上的Python应用程序中。

Answer 3

您可能能够在应用程序本身中打包所需的所有库，但更优雅的解决方案是在git上克隆Heroku Python Buildpack，并修改它以包含库。然后，您可以指示您的应用程序在命令行客户端上使用带有--buildpack标志的已修改的buildpack。

编辑：我最初没有点击查看其他答案，但听起来你已经在使用自定义buildpack了。您正在使用的buildpack有各种custom steps下载custom binaries。二进制文件是在64位Debian下编译的。

您应该能够剖析buildpack用于查找--prefix的其他自定义二进制文件，以查找./configure并构建所需的额外库。这不是简单或方便，但它应该像numpy和scipy一样工作。

Answer 4

如果你像我一样在安装 scikit learn 时遇到问题并出现错误，

ImportError: numpy is not installed.
scikit-learn requires numpy >= 1.11.0.

您需要做的是检查本地/开发环境的版本，并在部署时使用特定版本，甚至是 python 版本。

使用 zenpoy 或以下提到的 pip freeze。

import scipy
import sklearn
import numpy

print(scipy.__version__)
print(sklearn.__version__)
print(numpy.__version__)

专门将此版本添加到 requirements.txt

scipy==1.4.1
scikit-learn==0.22.2.post1
numpy==1.19.5

在 heroku 到 set the Python runtime 中，将 runtime.txt 文件添加到应用的根目录，声明要使用的确切版本号：

python-3.7.10

Answer 5

我在Python3上为此创建了一个buildpack：https://github.com/dwnld/heroku-buildpack-python3-sklearn

Answer 6

使用conda buildpack并添加＆＃39; nomkl＆＃39;到conda-requirements.txt文件以获得sluizeize。

如何在heroku雪松上安装scikit-learn？

6 个答案: