Question

我一直无法解决这个问题，我认为问题可能在于我制作列表清单的方式。任何人都可以帮忙吗？谢谢！

我希望的结果是

codondict = {'A'：['GCT'，'GCC'，'GCA'，'GCG']，'C'：['TGT'，'TGC']，＆amp; c

但我得到的是：

{'A'：'A'，'C'：'C'，＆amp; c。

这是我的终端：

A = [ 'GCT'， 'GCC'， 'GCA'， 'GCG']

C = [ 'TGT'， 'TGC']

D = ['GAT'，'GAC']

E = [ 'GAA'， 'GAG']

F = [ 'TTT'， 'TTC']

G = [ 'GGT'， 'GGC'， 'GGA'， 'GGG']

H = [ '猫'， 'CAC']

I = [ 'ATT'， 'ATC'， 'ATA']

K = [ 'AAA'， 'AAG']

L = [ 'TTA'， 'TTG'， 'CTT'， 'CTC'， 'CTA'， 'CTG']

M = [ 'ATG']

N = [ 'AAT'， 'AAC']

P = [ 'CCT'， 'CCC'， 'CCA'， 'CCG']

Q = [ 'CAA'， 'CAG']

R = [ 'CGT'， 'CGC'， 'CGA'， 'CGG'， 'AGA'， 'AGG']

S = [ 'TCT'， 'TCC'， 'TCA'， 'TCG'， 'AGT'， 'AGC']

T = [ 'ACT'， 'ACC'， 'ACA'， 'ACG']

V = [ 'GTT'， 'GTC'， 'GTA'， 'GTG']

W = [ 'TGG']

Y = [ 'TAT'， 'TAC']

氨基酸= [ 'A'， 'C'， 'd'， 'E'， 'F'， 'G'， 'H'， 'I'， 'K'， 'L'， 'M'， 'N'， 'P'， 'Q'， 'R'， 'S'， 'T'， 'V'， 'W'， 'Y']

from collections import defaultdict

codondict = defaultdict（列表）

对于氨基酸中的i：

...对于i中的j :(对于列表（i）中的j也是如此）

...... ... codondict [i] = j       ......

codondict

defaultdict（，{'A'：'A'，'C'：'C'，'E'：'E'，'D'：'D'，'G'：'G'，'F' ：'F'，'我'：'我'，'H'：'H'，'K'：'K'，'M'：'M'，'L'：'L'，'N'：' N'，'Q'：'Q'，'P'：'P'，'S'：'S'，'R'：'R'，'T'：'T'，'W'：'W' ，'V'：'V'，'Y'：'Y'}）

Answer 1

你可以试试这个：

condondict= dict(A=['GCT','GCC','GCA','GCG'],
C=['TGT','TGC'],
D=['GAT','GAC'],
E=['GAA','GAG'],
F=['TTT','TTC'],
G=['GGT','GGC','GGA','GGG'],
H=['CAT','CAC'],
I=['ATT','ATC','ATA'],
K=['AAA','AAG'],
L=['TTA','TTG','CTT','CTC','CTA','CTG'],
M=['ATG'],
N=['AAT','AAC'],
P=['CCT','CCC','CCA','CCG'],
Q=['CAA','CAG'],
R=['CGT','CGC','CGA','CGG','AGA','AGG'],
S=['TCT','TCC','TCA','TCG','AGT','AGC'],
T=['ACT','ACC','ACA','ACG'],
V=['GTT','GTC','GTA','GTG'],
W=['TGG'],
Y=['TAT','TAC'])

使用defaultdict()的原因是允许访问/创建字典值而不会导致KeyError，或使用表单旁路：

if key not in mydict.keys():
    mydict[key] = []
mydict[key].append(something)

如果您没有动态创建新密钥，则实际上不需要使用defaultdict()。

此外，如果您的密钥已经代表 aminoacids ，那么您只需迭代密钥本身。

for aminoacid, sequence in condondict.iteritems():
    # do stuff with with data...

Answer 2

执行所需操作的另一种方法是使用locals()函数，该函数返回包含本地范围的整个变量集的字典，变量名称作为键，其内容作为值。

for i in aminoacids:
    codondict[i] = locals()[i]

因此，您可以使用A获取locals()['A']列表。

Answer 3

这种冗长，并且将变量'A'的名称与其值A混淆。保持你所拥有的：

aminoacids = { 'A': A, 'C': C, 'D': D ... }

应该为您提供您要求的词典：

{ 'A' : ['GCT', 'GCC', 'GCA', 'GCG'], 'C' : ['TGT', 'TGC'], ... }

其中键'A'和'C'的顺序可能不是您获取的顺序，因为字典未被排序。

Answer 4

你也可以使用内置的globals（）和dict comprehension：

codondict = {k:globals()[k] for k in aminoacids}

最好依靠locals（）而不是globals（），比如stummjr的解决方案，但你不能直接用dict理解这样做

codondict = dict([(k,locals()[k]) for k in aminoacids])

但是你可以这样做：

loc = locals()
codondict = {k:loc[k] for k in aminoacids}

如果你改变氨基酸列表或氨基酸分配，最好使用更懒的东西，如：

codondict = lambda: {k:globals()[k] for k in aminoacids}

这个最后你总是可以使用更新的字典，但它现在是一个可调用的，所以使用codondict（）[x]而不是codondict [x]来获得一个真正的字典。这样你可以存储像hist = codondict（）这样的整个dict，以防你需要比较不同的codondict历史版本。这个小到足以在交互模式下有用，但不建议在更大的代码中使用。

从列表列表中创建字典

4 个答案: