在同一ggplot中绘制离散和连续的比例

时间:2012-07-16 16:53:14

标签: r graphics ggplot2 gis

我想使用ggplot2绘制一些不同的数据项,使用两个不同的色标(一个连续,一个离散来自两个不同的df)。我可以准确地描绘出我个人喜欢的方式,但我不能让它们一起工作。看起来你不能在同一个情节中运行两种不同的色标吗?我已经看到了类似的问题herehere,这让我相信我想要实现的目标在ggplot2中根本不可能,但为了防止我错了我想说明我的问题是看是否有解决办法。

我有一些GIS流数据,附有一些分类属性,我可以在下面的代码中绘制(p1)以获得: enter image description here

我还有一组具有连续响应的位置,我也可以在下面的代码中绘制(p2)以获得: enter image description here 但是我无法将两者结合起来(下面的代码为p3)。我收到此错误

  

尺度误差[[prev_aes]]:尝试选择少于一个元素

注释掉scale_colour_hue("Strahler order") +行会将错误更改为

  

错误:提供给连续刻度的离散值

基本上,似乎ggplot2对geom_path调用和geom_point调用使用相同的比例类型(连续或离散)。因此,当我将离散变量factor(Strahler)传递给scale_colour_gradientn时,绘图失败。

有解决方法吗?如果scale函数有data参数告诉它应该映射或设置属性,那将是惊人的。这甚至可能吗?

非常感谢和重现以下代码:

library(ggplot2)

### Download df's   ###
oldwd <- getwd(); tmp <- tempdir(); setwd(tmp)
url <- "http://dl.dropbox.com/u/44829974/Data.zip"
f <- paste(tmp,"\\tmp.zip",sep="")
download.file(url,f)
unzip(f)


### Read in data    ###
riv_df <- read.table("riv_df.csv", sep=",",h=T)
afr_df <- read.table("afr_df.csv", sep=",",h=T)
vil_df <- read.table("vil_df.csv", sep=",",h=T)


### Min and max for plot area   ###
xmin <- -18; xmax <- 3; ymin <- 4; ymax <- 15


### Plot river data ###
p1 <-   ggplot(riv_df, aes(long, lat)) + 
    geom_map( mapping = aes( long , lat , map_id = id ) , fill = "white" , data = afr_df , map = afr_df ) +
    geom_path( colour = "grey95" , mapping = aes( long , lat , group = group , size = 1 ) , data = afr_df ) +
    geom_path( aes( group = id , alpha = I(Strahler/6) , colour = factor(Strahler) , size = Strahler/6 ) ) +
    scale_alpha( guide = "none" ) +
    scale_colour_hue("Strahler order") +
    scale_x_continuous( limits = c( xmin , xmax ) , expand = c( 0 , 0 ) ) +
    scale_y_continuous( limits = c( ymin , ymax ) , expand = c( 0 , 0 ) ) +
    coord_map()
print(p1) # This may take a little while depending on computer speed...



### Plot response data  ###
p2 <- ggplot( NULL ) +
    geom_point( aes( X , Y , colour = Z) , size = 2 , shape = 19 , data = vil_df ) +
    scale_colour_gradientn( colours = rev(heat.colors(25)) , guide="colourbar" ) +
    coord_equal()
print(p2)



### Plot both together  ###
p3 <-   ggplot(riv_df, aes(long, lat)) + 
    geom_map( mapping = aes( long , lat , map_id = id ) , fill = "white" , data = afr_df , map = afr_df ) +
    geom_path( colour = "grey95" , mapping = aes( long , lat , group = group , size = 1 ) , data = afr_df ) +
    geom_path( aes( group = id , alpha = I(Strahler/6) , colour = factor(Strahler) , size = Strahler/6 ) ) +
    scale_colour_hue("Strahler order") +
    scale_alpha( guide = "none" ) +
    scale_x_continuous( limits = c( xmin , xmax ) , expand = c( 0 , 0 ) ) +
    scale_y_continuous( limits = c( ymin , ymax ) , expand = c( 0 , 0 ) ) +
    geom_point( aes( X , Y , colour = Z) , size = 2 , shape = 19 , data = vil_df ) +
    scale_colour_gradientn( colours = rev(heat.colors(25)) , guide="colourbar" ) +
    coord_map()
print(p3)
#Error in scales[[prev_aes]] : attempt to select less than one element

### Clear-up downloaded files   ###
unlink(tmp,recursive=T)
setwd(oldwd)

干杯,

西蒙

3 个答案:

答案 0 :(得分:9)

你可以这样做。您需要告诉网格图形将一个图叠加在另一个图之上。你来获得边距和间距等,完全正确,你必须考虑顶层的透明度。简而言之...... 它不值得。以及可能使情节混乱。

然而,我认为有些人可能会喜欢如何实现这一点。注:我使用code from this gist使顶部图中的元素透明,因此它们不会使下面的元素不透明:

grid.newpage()
pushViewport( viewport( layout = grid.layout( 1 , 1 , widths = unit( 1 , "npc" ) ) ) ) 
print( p1 + theme(legend.position="none") , vp = viewport( layout.pos.row = 1 , layout.pos.col = 1 ) )
print( p2 + theme(legend.position="none") , vp = viewport( layout.pos.row = 1 , layout.pos.col = 1 ) )

请参阅我的回答here,了解如何将图例添加到网格布局的另一个位置。

enter image description here

答案 1 :(得分:5)

问题并不像你想象的那么复杂。一般来说,您只能映射一次美学。所以调用scale_colour_*两次对ggplot2毫无意义。它会试图强迫一个人进入另一个。

无论是连续的还是离散的,您都不能在同一个图表中使用多个色阶。包裹作者说,他们也无意添加这个。它实现起来相当复杂,并且使得制作令人难以置信的混乱图表变得太容易了。 (出于类似的原因,永远不会实现多个y轴。)

答案 2 :(得分:2)

我目前没有时间提供完整的工作示例,但还有另一种方法可以在此处提及:Fill and border colour in geom_point (scale_colour_manual) in ggplot

基本上,将geom_point与 .//////////// CircleShape shape = new CircleShape(); shape.setRadius(1f); FixtureDef fixtureDef = new FixtureDef(); fixtureDef.shape = shape; body.createFixture(fixtureDef); shape.dispose(); } 结合使用可让您使用shape = 21, color = NA而不是fill美学来控制一系列点的颜色。这是我的代码看起来像这样。我知道没有提供数据,但希望它为您提供了一个起点:

color

注意每次调用geom_point如何调用不同的审美(biloxi + geom_point(data = filter(train, primary != 'na'), aes(y = GEO_LATITUDE, x = GEO_LONGITUDE, fill = primary), shape = 21, color = NA, size = 1) + scale_fill_manual(values = c('dodgerblue', 'firebrick')) + geom_point(data = test_map_frame, aes(y = GEO_LATITUDE, x = GEO_LONGITUDE, color = var_score), alpha = 1, size = 1) + scale_color_gradient2(low = 'dodgerblue4', high = 'firebrick4', mid = 'white', midpoint = mean(test_map_frame$var_score)) color