Python迭代字符

Question

我一直试图在ACGT基因组中拉中值字符串搜索序列。我遇到的问题是AAAAAAAA到AAAAAAAC等等，直到我尝试了所有可能的组合。

通过创建两个列表，一个包含A，C，G，T和另一个包含8个字符的序列，以及每次搜索迭代和交换字符后，我基本上都在蛮力。问题是我没有测试所有组合，因为当两个迭代同时它跳过一个字母时。

有没有办法轻松去AAAAAAAA - AAAAAAAC - AAAAAAAG - AAAAAAAT - AAAAAACA等等？

Answer 1

使用itertools

itertools.product("ACGT", repeat=8)

Answer 2

如上所述使用itertools，

itertools.product("ACGT", repeat=8) # will work in your case.

Answer 3

使用pyparsing wiki示例页面中的regex inverter，反转此正则表达式：[ACGT]{8}。你也可以尝试online inverter at the UtilityMill，但是这个服务器在生成8个字符的字符串时会超时，但我在允许的时间内成功获得了6个字符。