如何使用SED删除不是[ACGTN]的字符

Question

如何用sed替换任何不是“A”，“C”，“G”，“T”，“N”的字符串？

例如，我有以下数据：

>AFCCCCC 1
cagktgagtgataaggc
>AFCGH22 1
cagntgagtgstaaggc

我想删除不是以'＆gt;'开头的不是[ACGTN]的所有字符

因此我希望得到这个输出：

 >AFCCCCC 1
 cagtgagtgataaggc
 >AFCGH22 1
 cagntgagtgtaaggc

请注意，我删除了第一个和第二个序列的'k'和's'。

Answer 1

试试这个：

sed '/^>/!s/[^ACGTN]//ig' input.txt