Question

我有Windows 7操作系统。我按照PETSc web page的说明进行了操作;在VS 2005的命令提示符中，我打开了cygwin并使用以下命令安装了PETSc：

./configure --with-cc='win32fe cl' --with-fc=0 --with-mpi=0 --download-f2cblaslapack

我尝试从网页运行以下示例：

cd src/ksp/ksp/examples/tutorials

make ex2

ex2.c是一个c程序代码。我收到以下错误：

$ make ex2

makefile:18: /conf/variables: No such file or directory

makefile:19: /conf/rules: No such file or directory

makefile:1151: /conf/test: No such file or directory

make: *** No rule to make target `/conf/test'.  Stop.

造成这种情况的原因是什么？

（更重要的是）我该如何解决？

*编辑：我也可以使用一般性答案，因为目前我甚至不知道谷歌会做什么，我不想只是联系PETSc支持。

我决定在Ubuntu上工作。所以现在，这是交易。安装完成后我写道：

gcc -I $ PETSC_DIR /包含-L $ PETSC_DIR / $ PETSC_ARCH / lib -libpetsc ex2

在命令行中。我得到了错误的按摩：

/ usr / bin / ld：找不到-libpetsc ex2：在函数_start': (.text+0x1bc4): multiple definition of _ start'中 /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../x86_64-linux-gnu/crt1.o:(.text+0x0）：首先在这里定义 ex2：在函数_fini': (.fini+0x0): multiple definition of _ fini'中 /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../x86_64-linux-gnu/crti.o:(.fini+0x0）：首先在这里定义 ex2 :(。rodata + 0x0）：_IO_stdin_used' /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../x86_64-linux-gnu/crt1.o:(.rodata.cst4+0x0): first defined here ex2: In function __ data_start'的多重定义：（.data + 0x0）：__data_start' /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../x86_64-linux-gnu/crt1.o:(.data+0x0): first defined here ex2: In function __ data_start'的多重定义：（.data + 0x8）：__dso_handle' /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/crtbegin.o:(.data+0x0): first defined here ex2: In function _ init'的多重定义：（.init + 0x0）：`_init'的多重定义 /usr/lib/gcc/x86_64-linux-gnu/4.6/../../../x86_64-linux-gnu/crti.o:(.init+0x0）：首先在这里定义 collect2：ld返回1退出状态

Answer 1

如PETSc web page部分遇到问题？部分所述，与make相关的问题需要设置PETSC_DIR和PETSC_ARCH配置。

造成这种情况的原因是什么？：
makefile目录中的src/ksp/ksp/examples/tutorials引用PETSC_DIR以包含配置文件，即

include ${PETSC_DIR}/conf/variables
include ${PETSC_DIR}/conf/rules

...
include ${PETSC_DIR}/conf/test

现在正在执行make只是make ex2（从错误中它表示您没有设置PETSC_DIR变量），${PETSC_DIR}为空，因此{{ 1}}尝试包含make，/conf/variables＆amp; /conf/rules个不存在的文件。

如何解决？
您必须按照网站上的说明运行/conf/test make
在此之前，您需要正确构建源。要澄清你在问题make PETSC_DIR=<dir_output_from_configure> PETSC_ARCH=<arch_output_from_configure> ex2中提到的内容，不会安装PETSc，只会配置构建源。您需要运行./configure ...。如果成功运行make，则会输出包含configure和PETSC_DIR的配置详细信息。样本输出：

PETSC_ARCH

然后您按照./configure --with-mpi=0 =============================================================================== Configuring PETSc to compile on your system =============================================================================== TESTING: alternateConfigureLibrary from PETSc.packages.petsc4py(config/PETSc/packages/petsc4py.py:65) Compilers: ... ... PETSc: PETSC_ARCH: arch-linux2-c-debug PETSC_DIR: /XXXX/petsc-3.3-p1 Clanguage: C Scalar type: real Precision: double shared libraries: disabled dynamic loading: disabled Memory alignment: 16 xxx=========================================================================xxx Configure stage complete. Now build PETSc libraries with (cmake build): make PETSC_DIR=/XXXX/petsc-3.3-p1 PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug all or (experimental with python): PETSC_DIR=/XXXX/petsc-3.3-p1 PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug ./config/builder.py xxx=========================================================================xxx的输出中的说明运行了make PETSC_DIR=/XXXX/petsc-3.3-p1 PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug all。这将构建库。现在您应该能够构建示例了。（请注意，这是在Linux上运行的，你应该能够在cygwin上做同样的事情）
附注：似乎没有必要设置configure来构建示例，您应该能够使用PETSC_ARCH构建

希望这有帮助！

Answer 2

我遇到了同样的问题。你只需要一个修复。在显示上述错误的makefile中，只需在makefile中为PETSC_DIR变量赋值。例如，对我来说是

PETSC_DIR = /用户/ kanikas /文档/研究/ PETSc的/ PETSc的-3.5.2

注意：PETSC_DIR应该是petsc的根目录。

Answer 3

我正在直接在〜/ .bashrc中添加导出路径。这样我就不需要一遍又一遍地写道。

sudo nano ~/.bashrc

转到文件的最后一行：

#PETScXXX
export PETSC_DIR=/home/username/PETSc/petsc-3-8
export PETSC_ARCH=arch-linux2-c-debug

每次启动shell时，您都可以访问正确的petsc路径和库。

我希望这可以对某人有所帮助。（运行Xubuntu 16.04 64位）

PETSc示例不起作用

3 个答案: