我正忙着编写一个可以从FTP下载一些文件的脚本,我想要一个select语句来给出ftp子目录中的directorys。但是也要给出一个选项下载所有这些应该发生@ $ DNAtype在底部。有人有什么想法吗?
我的代码是:(抱歉荷兰评论)
#!/bin/bash/
#16-03-2012
#Sander van der Zeeuw s1040176
#Variabele om de ftp aan te kunnen roepen
var='ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-66/fasta/'
#Hier word de lijst met beschikbare organisme binnengehaald via de functie curl.
# curl is te installeren via de terminal met het command sudo apt-get install curl
lijst=`curl $var | awk '{print $NF}'`
echo "de keuze 0 selecteert alles"
#hier wordt een directory aangemaakt om de files in weg te schrijven
mkdir -p dnaenpep
cd dnaenpep
#Hier wordt een keuze menu gecreeerd om het juiste organisme te kiezen.
select specie in $lijst
do
break
done
echo "Uw keuze is:" $specie
#Hier wordt de keuze "0" ingebouwd. Zodat alle genomen gedownload worden.
if [ "$specie" == "" ]
then
for i in $lijst
do
namen=$(curl $var$i/dna/ | awk '{print($NF)}')
for files in $namen; do curl $var$i/dna/$files -o $files
curl $var$i/pep/$files -o $files
done
done
fi
echo "de keuze 0 selecteert alles"
#Wanneer de loop niet uitgevoerd wordt, zal via nog een select statement de gekozen worden #welk DNA je van de ftp wil downloaden.
lijst2=`curl $var$specie/ | awk '{print $9}'`
echo $lijst2
select dnatype in $lijst2
do
break
done
echo "uw keuze is:" $dnatype
if [$dnatype == ""]
then
for i in $dnatype
do
wget -O DNAtype "$var$specie/dna/"
wget -O DNAtype "$var$specie/pep/"
done
fi
#Hier worden de files die in $dnatype gemaakt worden gedownload.
wget -O DNAtype "$var$specie/$dnatype/"
cat DNAtype | egrep "=" | tr '"' '\n' | sort | grep ^"ftp" |grep gz > Downlist.txt
wget -c -i Downlist.txt
exit
答案 0 :(得分:1)
您的select语句应使用数组,您可以向数组中添加其他项,或者在select
语句中的数组名称之后添加它们。
lijst2=($(curl "$var$specie/" | awk '{print $9}')
lijst2+=("Another option" "Additional option" "Download all")
echo "${lijst2[@]}"
select dnatype in "${lijst2[@]}"
do
break
done
echo "uw keuze is: $dnatype"
或
lijst2=($(curl "$var$specie/" | awk '{print $9}')
echo "${lijst2[@]}"
select dnatype in "${lijst2[@]}" "Another option" "Additional option" "Download all"
do
break
done
echo "uw keuze is: $dnatype"
您选择哪个取决于您是否想要在数组中添加选项。
要下载所有内容,只需迭代数组(因此您可能希望使用第二个版本,因此您不必跳过“全部下载”,例如,因为它不是文件名。
附加说明:
使用$()
代替反引号进行命令替换。
此声明if [$dnatype == ""]
需要空格:if [ $dnatype == "" ]
。
在扩展时引用所有变量。你在某些地方已经这样做了,但其他地方却没有。
接近尾声的长管道几乎可以简化。没有看到示例数据,我只能猜测如何。