Question

我有几个文件格式如下：

TCTCTGGAAAGGGACGCCTGGGAGG   10
AAAAATACATTCTAACCTCGGCGT    1
TAATTTCATCAATATATCAATG  1
(etc...)

我想删除空格后的所有内容，以便我最终得到这个：

TCTCTGGAAAGGGACGCCTGGGAGG
AAAAATACATTCTAACCTCGGCGT
TAATTTCATCAATATATCAATG
(etc...)

我该怎么做？

Answer 1

您可以使用awk执行此操作：

cat oldfile | awk '{print $1}' > newfile

Answer 2

cut -d' ' -f1 file.txt

或：

sed 's/ .*//' file.txt

或

sed -e 's/[^ACTG]//g' file.txt

或

awk '{print $1}' file.txt

Answer 3

不像timos的答案那样简洁和漂亮:)，但是另一个相同功能的快速示例，但是用Ruby编写。

#!/usr/bin/env ruby

data = File.read("data.txt")
f = File.open("outData.txt", "w")
finalData = data.scan(/^\w+/)
finalData.each {|i| f.write(i + "\n")}
f.close

终端编辑文件删除某些字符

3 个答案: