有没有办法使用RStudio直接从工作区中编织降价？

Question

我想知道我是否可以使用knitr markdown来创建一个动态报告，其中包含源自当前工作空间的对象。再现性不是问题。我也读得很好thread here。

但是我仍然收到一条错误消息，抱怨无法找到特定对象。

1）假设我打开一个新的降价文档并保存。

2）编写一个引用我工作区中某个lm对象的块。致电summary(mylmobject)

3）编织它。

不幸的是生成了报告，但无法显示回归输出，因为无法找到该对象。注意，如果我只是将对象保存到.Rdata然后直接从markdown文件加载它，它通常工作。

有没有办法在当前工作区中使用R markdown中的对象？ 这对于非R人在继续工作时显示一些输出非常好。

Answer 1

RStudio打开一个新的 R会话到你的R Markdown文件knit()，因此当前工作空间中的对象将无法用于该会话（它们是两个单独的会话）。两种解决方案：

1. 向RStudio提交feature request，要求他们支持当前R会话中的编织，而不是强行开始新会话;
2. 由您自己手动编织：library(knitr); knit('your_file.Rmd')（或knit2html()如果您希望一步完成HTML输出，或rmarkdown::render()如果您使用R Markdown v2）

Answer 2

使用以下方法可能更容易从其他会话中保存数据：

save.image("C:/Users/Desktop/example_candelete.RData")

然后将其加载到MD文件中：

load("C:/Users/Desktop/example_candelete.RData")

Answer 3

Markdownreports package完全用于动态解析降价文档。

Answer 4

正如Julien Colomb评论的那样，我发现在这种情况下最好的办法是保存大型物体，然后在我定制降价时明确加载它们。如果您的数据是通过ODBC发送的，并且您不希望在修改字体和主题时重复运行整个查询，则必须这样做。