Question

可能重复：
geom_boxplot with precomputed values

我有一张表，其中每行是不同的样本，每列分别是名称，最小值，最大值，平均值，第25百分位数，第50百分位数，第75百分位数。这是一个样本。

sample1   1   38   10   8    10   13
sample2   1   39   10   9    11   14
sample3   2   36   11   10   10   13

我想知道如何使用这种格式的数据来绘制箱图，因为这是实际绘制的数据。上面的格式是一个制表符分隔表。感谢

Answer 1

This post显示了如何使用bxp boxplot使用的函数执行此操作，但您需要按正确的顺序放置数据，第一行是最小的，最后一行是最大值。

首先，读入数据

dat <- read.table(text="sample1   1   38   10   8    10   13
sample2   1   39   10   9    11   14
sample3   2   36   11   10   10   13", row.names=1, header=FALSE)

然后，按顺序和t ranspose

dat2 <- t(dat[, c(1, 4, 5, 6, 2)]) #Min, 25pct, 50pct, 75pct, Max

和情节

bxp(list(stats=dat2, n=rep(10, ncol(dat2)))) #n is the number of observations in each group

Answer 2

这是一个副本，但是对于后人而言，因为我已经开始写...

dat <- data.frame(name=paste0('sample',1:3), min=c(1,1,2), max=c(38,39,36), mean=c(10,10,11), q25=c(8,9,10), q50=c(10,11,10), q75=c(13,14,13))

ggplot(dat, aes(x=name, ymin=min, ymax=max, lower=q25, middle=q50, upper=q75))+geom_boxplot(stat='identity')

给出25,50,75百分位数和最小值和最大值的R中的bloxplots

2 个答案: