我需要编写一个MPI程序,它必须在不同的集群节点上启动几个进程。这是我的示例代码。
#include <stdio.h>
#include <mpi.h>
int main(int argc, char *argv[]) {
int rank, size, nodenamesize;
char nodename[100];
MPI_Init(&argc, &argv);
MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &rank);
MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &size);
MPI_Get_processor_name(nodename, &nodenamesize);
printf("Hello world! I am %d of %d running on %s\n", rank, size, nodename);
if (rank == 0) {
system("./Longwait&");
} else if (rank == 1) {
system("./AnotherLongWait&");
}
MPI_Finalize();
return 0;
}
它成功启动了进程,但MPI应用程序并未自行终止。它甚至在调用MPI_Finalize()之后等待。
这段代码有什么问题?我需要做些什么才能使MPI程序只需启动其他一些应用程序,但不应等待任何事情。
谢谢你, 问候, 机器人。
答案 0 :(得分:2)
延迟的原因是Open MPI用于提供I / O重定向的机制。提示:使用system("ls -l /proc/self/fd");
或system("lsof -c lsof");
可以了解system(3)
生成的子进程中打开了多少个文件描述符。这些描述符由Longwait
和AnotherLongWait
保持打开状态,这使得MPI运行时等待它们完成。
以下是一个简单示例,其中包含两个非常简单的Longwait
示例版本:
第1版:睡1分钟
#include <unistd.h>
int main (void)
{
sleep(60);
return 0;
}
如果您使用system("./Longwait&");
生成此程序,则必须等到mpirun
/ mpiexec
完成后才能完成。
版本2:在睡觉前盲目关闭前20个文件描述符
#include <unistd.h>
int main (void)
{
int i;
for (i = 0; i < 20; i++)
close(i);
sleep(60);
return 0;
}
如果你像以前一样生成这个程序,{MPI程序退出后不久就会完成mpirun
/ mpiexec
可执行文件。
现在这是不一个真正的解决方案 - 随机关闭打开的文件描述符会产生不可预测的影响。找出应该关闭哪些描述符既不容易也不便携。我通常建议不要在你的代码中做你做的事情。除了Open MPI,它还不能可靠地支持具有InfiniBand互连的系统上的进程分支(system(3)
在后台使用fork(2)
。)