Question

igraph新手。我希望顶点颜色由另一个参数定义，最好是连续颜色（想想热图或灰度）。

clusters_only <- as.character(temp_df$SeqID)
v_names <- data.frame(c(unique_order, as.character(temp_df$SeqID)))
graph_order <- graph.data.frame(temp_df, directed = FALSE, vertices = v_names)
V(graph_order)[clusters_only]$size <- ? #continuous colour based on variable in temp_df

有什么想法吗？

非常感谢。

Answer 1

您可以使用顶点的color属性指定顶点颜色。它可以是一个字符串（包含R已知的颜色名称）或数值，在这种情况下，颜色将从当前调色板中选择。 E.g：

library(igraph)
g <- grg.game(100, 0.2)
V(g)$color <- 1:100
palette(gray.colors(100))
plot(g)

或者，您可以将颜色指定为plot的参数，而不是将它们指定给顶点属性：

plot(g, vertex.color <- 1:100)

Answer 2

我的运气方式好多了：

R> library(igraph)
R> g <- grg.game(100, 0.2)
R> V(g)$color <- 1:100
R> g$palette <- grey.colors(100)    ####  updated this line
R> plot(g)

自从原始答案以来，语法可能已经改变了吗？

按条件着色的igraph + R顶点（最好是连续颜色）

2 个答案: