Question

新手python程序员在这里。我编写了一个脚本，并希望修改它以便它运行文件夹中的文件，因此我不必每次都更改输入和输出文件扩展名。

输入文件的文件夹包含染色体文件，例如'chr1'，'chr2'，'chrx'等。我想输出到不同的文件夹和路径，并使用输入文件作为输出文件的基础，同时还添加了一个扩展名，如'windowstatistics'。例如，输入文件'chr1'将作为'chr1windowstatistics'输出到不同的文件夹中。

我一直试图解决这个问题几天没有得到有效的解决方案。

目前我有：

import os
import glob

path = '/man/genotyping/Conservation/splitbychrom/'
for infile in glob.glob( os.path.join(path, 'Chr*') ):


    inputfile = open(infile, 'r') 
    output = os.rename(inputfile + ".out", 'w')

有谁知道如何使这个工作，我不介意它的完成方式是完全不同的，我只是希望能够运行一次脚本并迭代文件。

如果我需要重新表述问题，请告诉我。在此先感谢您的帮助。真的很感激。

Answer 1

记下你想要的东西 - 我不清楚。

要重命名吗？然后告诉os.rename()您要重命名的内容和内容。在您的情况下，您想要将orognal文件重命名为新名称，当然不是w。 os.rename(infile, newfilename)。

output = open(infile + ".out", 'w')

您是否要处理输出数据并将其放在其他位置？然后打开文件进行写入，并使用正确的文件名：执行{{1}}。

特别是不要将文件名与文件对象混淆，特别是函数如何工作。

Answer 2

要重命名文件： os.rename（infile，infile +“。out”）

os.rename有两个字符串：源路径，目标路径。 “输出”的分配未使用。

复制文件（* nix）： os.system（“cp”+ infile +“”+ infile“+”。out“）

使用python输入扩展后迭代文件和名称输出文件

2 个答案: