我们如何从java调用R语言/ R脚本?基本上我需要围绕R脚本的java类包装器。
数据将提供给java层说方法setData(double []),它应该依次发送给R脚本 - 让我们说setDataR(double [])方法。
R脚本将执行一些计算,称调用方法double [] computeR()。
Java程序将通过调用double [] getData()获取计算结果,而double [] getData()依次委托R脚本获取计算数据。
如何通过JRI,Rserv,Rcaller执行此操作?我没有看到任何调用Rscript方法的方法?请发送样品。它应该与JNI(java,C ++)调用类似。
由于
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从Java使用R的最简单方法是使用Runtime.exec("")
,抓取响应并解析它。有关如何运行本机指令的典型示例如下:
Process p = Runtime.getRuntime().exec("ls");
BufferedReader stdInput = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getInputStream()));
BufferedReader stdError = new BufferedReader(new InputStreamReader(p.getErrorStream()));
从这里,您可以阅读并处理打印到缓冲到stdInput
的标准输出的结果。
答案 1 :(得分:0)
RCaller完全按照你的意愿行事。假设你有一个双阵列' a'定义为
double[] a = new double[] {1.0, 2.0, 3.0};
并且您想要计算平均值,中位数和标准差值。创建一个新的RCaller实例
RCaller caller = new RCaller();
Globals.detect_current_rscript();
caller.setRscriptExecutable(Globals.Rscript_current);
RCode code = new RCode();
code.addDoubleMatrix("a", a);
code.addRCode("s <- list(mean=mean(a), median=median(a), sd=sd(a))");
caller.setRCode(code);
caller.runAndReturnResult("s");
double mean = caller.getParser().getAsDoubleArray("mean")[0];
double median = caller.getParser().getAsDoubleArray("median")[0];
double sd = caller.getParser().getAsDoubleArray("sd")[0];
并且变量median保存从R脚本返回的值2.0。有关详细信息,请访问页面here