并行化动态数组

时间:2012-05-29 10:55:29

标签: c++ parallel-processing neural-network dynamic-arrays backpropagation

这是神经网络上反向传播算法代码的一部分。

在我们的例子中,我们想要并行化for(pt = 0; pt< N_PT_pair; pt ++)循环,for(epoch = 0; epoch< MaxEpoch; epoch ++)不能并行化。

initialize W1[ ] [ ] and W2[ ][ ] with random values
for(epoch=0; epoch<MaxEpoch; epoch++)
     dW1[ ][ ]=0.0; dW2[ ][ ]=0.0; //sum of weight corrections
     sse = 0; // Sum of square of errors
     for( pt=0; pt<N_PT_pair; pt++)
          input = pattern[pt];
          compute output  // procedure as above
          compare target[pt] and output and
          compute dW2[ ][ ] += ... // procedure to be described
          compute dW1[ ][ ] += ... // procedure to be described
          for(k=1; k<=Noutput; k++) 
              sse+=pow((target[pt][k]-output[k]),2);
     end pt for loop   
     cout << "mean square error" << sse/N_PT_pair;
     W1[ ][ ] += rate*dW1[ ][ ]
     W2[ ][ ] += rate*dW2[ ][ ]
end epoch for loop

这些是分配和解除分配数组的代码

double** allocate_matrix(int rows,int cols) 
{    
    double **a;

    a = new double*[rows];    
    if(a==NULL){cout<<"matrix allocation failed"<<endl;exit(-1);}

    for (int j=0;j<rows;j++){   
       a[j] =  new double[cols];
       if(a[j]==NULL) {cout<<"matrix allocation failed"<<endl;exit(-1);}    
    }

    return a;
}

int deallocate_matrix(double**a,int rows)    
{
    for(int i=0;i<rows;i++)
       delete [] a[i];
    delete [ ] a;    
    return 0;
}

你可以帮我们并行化代码吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

如果内部循环中的迭代彼此独立,那么您可以简单地从一个OpenMP构造开始:

#pragma omp parallel for private(input,k) reduction(+:sse)
for( pt=0; pt<N_PT_pair; pt++)
     input = pattern[pt];
     compute output  // procedure as above
     compare target[pt] and output and
     compute dW2[ ][ ] += ... // procedure to be described
     compute dW1[ ][ ] += ... // procedure to be described
     for(k=1; k<=Noutput; k++) 
         sse+=pow((target[pt][k]-output[k]),2);
end pt for loop

如果在多次迭代中没有更新dW1dW2的元素,那么这将非常有用,否则将需要原子访问并且会破坏性能(OpenMP仍然不支持减少C / C ++中的数组。

如果您有大量的网络权重,您也可以以相同的方式并行化乘法。

并行区域可以进一步移出外部循环以减少OpenMP开销,singlemaster OpenMP指令可用于隔离应该只在单个线程中运行的代码

为了让编译器理解#pragma omp指令,您必须启用OpenMP支持。具体如何是编译器具体完成的:

  • -fopenmp代表GCC
  • -openmp for Intel C / C ++ Compiler
  • -xopenmp for Oracle Solaris Studio
  • 项目属性 - &gt;等等。用于MS Visual Studio