所以我在perl中调用外部程序并想要捕获它的输出:
my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters`;
如果从命令行调用,则输出由三行组成,例如:
4 sequences; length of alignment 48.
__GCCGA_UGUAGCUCAGUUGGG_AGAGCGCCAGACUGAAAAUCAGA
...((((.....((((.........)))).(((((.......)))))
然而,我的数组@RNAalifoldOut
仅包含最后两行,并且在执行该行时,第一行直接出现在屏幕上。
这怎么可能?我想也许程序会将第一行写入STDERR
,但是反引号运算符不会丢弃它吗?我该怎么做才能隐藏这个输出?
此致 尼克
答案 0 :(得分:8)
您可能会看到来自 RNAalifold 的标准错误。反引号仅捕获标准输出。
通过将代码更改为
来捕获标准输出和标准错误my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters 2>&1`;
要丢弃标准错误,请使用
my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters 2>/dev/null`;
在类Unix平台上。在Windows上,使用
my @RNAalifoldOut = `RNAalifold some parameters 2>nul`;