Question

在Rstudio 0.96的R Markdown文件中按“编织HTML”时会运行哪些命令？

我的动机是，当我在另一个文本编辑环境中时，我可能想要运行相同的命令，或者我可能想要在更大的makefile中组合命令。

Answer 1

基本脚本

现在是R markdown package has been released，这里有一些代码可以将Knit的功能复制到Html。

require(knitr) # required for knitting from rmd to md
require(markdown) # required for md to html 
knit('test.rmd', 'test.md') # creates md file
markdownToHTML('test.md', 'test.html') # creates html file
browseURL(paste('file://', file.path(getwd(),'test.html'), sep='')) # open file in browser

其中test.rmd是您的R降价文件的名称。请注意，我对browseURL行没有100％的信心（因此我的问题是关于opening files in a web browser）。

markdownToHTML选项

关于markdownToHTML的好处是，HTML的创建方式有很多选项（参见?markdownHTMLOptions）。因此，例如，如果您只想要一个没有所有标题信息的代码片段，您可以写：

markdownToHTML('test.md', 'test.html', options='fragment_only')

或者如果你不喜欢硬包装（即在降价源中有单个手动换行符时插入换行符），你可以省略'hard_wrap'选项。

# The default options are 'hard_wrap', 'use_xhtml', 
#      'smartypants', and 'base64_images'.
markdownToHTML('test.md', 'test.html', 
       options=c('use_xhtml', 'base64_images'))

生成文件

也可以使用Rscript -e（例如something like this）将其全部添加到makefile中。这是我放在一起的基本示例makefile，其中test表示rmd文件被称为test.rmd。

RMDFILE=test

html :
    Rscript -e "require(knitr); require(markdown); knit('$(RMDFILE).rmd', '$(RMDFILE).md'); markdownToHTML('$(RMDFILE).md', '$(RMDFILE).html', options=c('use_xhtml', 'base64_images')); browseURL(paste('file://', file.path(getwd(),'$(RMDFILE).html'), sep=''))"

makefile使用我首选的降价选项：即options=c('use_xhtml', 'base64_images')

Answer 2

将Sys.sleep(30)放入一个块中，您将清楚地看到RStudio调用的命令。基本上他们是

library(knitr); knit()获取降价文件;
RStudio具有将markdown转换为HTML的内部函数;

第二步将在下一版markdown包中更加透明。目前，您可以使用knitr::knit2html('your_file.Rmd')获取与RStudio相同的HTML文件。

Answer 3

来自knitr in a knutshell的非常简单的命令行方法：

R -e "rmarkdown::render('knitr_example.Rmd')"

这需要rmarkdown安装install.packages(rmarkdown)并安装pandoc（显然它附带Rstudio，有关详细信息，请参阅knitr in a knutshell。）

到目前为止，当我使用它时，它很好地将所有绘图放在HTML文件中，而不是图形目录中的图像，并清理任何中间文件，如果有的话;就像在RStudio中编译一样。

Answer 4

似乎你应该调用rmarkdown :: render（）而不是knitr :: knit2html（），因为a.rmd似乎是一个R Markdown v2文档。

如何将R Markdown转换为HTML？即，“编织HTML”在R96 0.96中做了什么？

4 个答案:

基本脚本

markdownToHTML选项

生成文件