Question

在R中，假设存在包含自变量“group”（两组）和n个因变量的数据帧“mydata”。我想运行n个t检验（每个因变量一个），通过执行以下操作打印并将结果保存到文件中：

variables<-names(mydata)
variables<-variables[-1] #to remove the group variable
capture.output(for(i in variables){print(t.test(get(paste("mydata$", i, sep=""))~mydata$group))},file="outputfile.txt")

此命令返回以下错误消息：

Error in get(paste("mydata$", i, sep = "")) : object 'mydata$variable1' not found

我做错了什么？

Answer 1

简短回答：get不适用于$个数据框元素。

更好的答案：使用paste构建整个公式，并将其作为一个元素发送给t.test。另外，请使用lapply。

set.seed(5)
x <- matrix(round(runif(100,0,10),1), ncol=10)
colnames(x) <- paste("var", 1:ncol(x), sep="")
mydata <- data.frame(group=gl(2,10), x)

variables <- names(mydata)[-1]
names(variables) <- variables

out <- lapply(variables, function(v) {
  t.test(as.formula(paste(v, "~ group")), data=d)
})

out

Answer 2

对于其他人，一些样本数据：

mydata <- data.frame(group=sample(1:2, 100, replace=T), variable1=rnorm(100), variable2=rnorm(100), variable3=rnorm(100))

我会更直接地使用：

for(i in variables) {
   t.test(mydata[i], mydata$group)
}

如果我使用for循环。但是，您可以使用更像R的样式来执行此操作：

lapply(variables, function(v, df=mydata) t.test(df[v], df$group))

t-test循环返回'找不到对象'错误

2 个答案: