使用bash脚本比较两个文件并写入新文件

Question

我是bash脚本的新手，想写一个bash脚本来执行以下操作。 我有两个制表符分隔文件，如下所示：

# file1 #
## position id 
.
.
.


# file2
## position type
. 
.
.

文件2是关于位置列的文件1的子集。 我想生成file3，使得对于file2中的每一行，它在file1中查找具有相同位置的行，并将以下内容写入file3

position id type
.
.
.

所以，我想基本上找到file1和file2（第一列）之间的公共位置，并将它们与它们的id和类型（相应文件中的第2列）一起写出来。 我知道如何使用python执行此操作，但我想学习如何使用bash脚本执行此类过程 - 我将感谢上述问题的任何示例代码。

  

额外注意事项：

每列中的值如下

• 职位：chr1：887799
• id：R2A
• 类型：analphabeticstring

由于

Answer 1

join -a 1 <(sort file1) <(sort file2)

应该带你去那里

联接的手册页有更多背景和样本：

• http://linux.die.net/man/1/join

Answer 2

首先，你需要将文件分隔开，然后就像

一样简单

join -j 1 first.txt second.txt