Linux上的两个/ gen文件夹？

Question

我在Ubuntu 11.10系统上使用IDEA 11.1。我通过Ctrl+F6重命名了主模块，然后IDEA创建了两个/gen个文件夹。看图像

上方/gen在括号中有完整路径（如/disk2/work/project/...）。较低的/gen包含通过桌面快捷方式的路径（如/home/user/Desktop/work/project/...）。两条路径都指向同一目录。

最顶层的文件夹具有新名称，而较低的文件夹（位于较高的gen目录下）具有项目的硬盘目录的名称。

有人可以建议如何合并吗？由于IDEA无法识别我为此项目添加的任何新资源，这让我很头疼。

我尝试删除所有.idea和其他配置文件并将项目重新创建到同一目录中（通过使用现有源文件命令创建项目），但它没有解决问题。

我还尝试通过“显示历史记录”功能撤消到之前的状态，但这是不可能的。这一步不是历史。

PS。对于黑线部分感到抱歉，但我被指示这样做。