Question

我的数据框A包含name和type。

name    aa  tt  gg  cc  aa  at  ag  ac

 type    3   2   4   3   2   2   3   3

如何使用B创建新的排名data.frame type并计算次数类型发生在data.frame A？

count   4   3   1   

type    3   2   4

感谢您的帮助。

Answer 1

一个选项是table()功能。对于您的数据：

dat <- data.frame(name = c("aa","tt","gg","cc","aa","at","ag","ac"),
                  type = c(3,2,4,3,2,2,3,3))

它给出了：

> (tab <- with(dat, table(type)))
type
2 3 4 
3 4 1

现在我们只需要对它进行排序：

> sort(tab, decreasing = TRUE)
type
3 2 4 
4 3 1

这些步骤当然可以合并：

> with(dat, sort(table(type), decreasing = TRUE))
type
3 2 4 
4 3 1

Answer 2

其他两种可能更快的方法：

rev(sort(tapply(dat$type, dat$type, length)))

x <- do.call('data.frame', (rle(sort(dat$type)))); x[order(-x$lengths), ]

编辑：没有Gavin的数据集，他提出的表格方法是最快的（在win7机器上使用微基准测试）：

Unit: microseconds
    expr     min      lq  median       uq      max
1    RLE 614.452 650.376 669.971 713.3605 104852.7
2  TABLE 562.664 586.691 607.453 645.9440 128596.5
3 TAPPLY 585.525 626.115 643.144 689.0995 118123.8

r创建一个使用类型的频率的汇总表

2 个答案: