适用于多个类别的if else风格录制的成语

时间:2012-05-03 12:29:07

标签: r r-factor recode

我经常遇到这种情况,我认为必须有一个很好的成语。假设我有一个包含一系列属性的data.frame,包括“product”。我还有一把钥匙,可以将产品转化为品牌+尺寸。产品代码1-3是Tylenol,4-6是Advil,7-9是拜耳,10-12是Generic。

最快(就人类时间而言)编码的方法是什么?

如果有3个或更少的类别,我倾向于使用嵌套的ifelse,并输出数据表并在有超过3的情况下将其合并。任何更好的想法? Stata有一个recode command,对于这类事情非常好看,尽管我认为它会促进数据代码混合有点过多。

dat <- structure(list(product = c(11L, 11L, 9L, 9L, 6L, 1L, 11L, 5L, 
7L, 11L, 5L, 11L, 4L, 3L, 10L, 7L, 10L, 5L, 9L, 8L)), .Names = "product", row.names = c(NA, 
-20L), class = "data.frame")

12 个答案:

答案 0 :(得分:19)

您可以将变量转换为系数,并通过levels<-函数更改其级别。在一个命令中它可能是:

`levels<-`(
    factor(dat$product),
    list(Tylenol=1:3, Advil=4:6, Bayer=7:9, Generic=10:12)
)

分步骤:

brands <- factor(dat$product)
levels(brands) <- list(Tylenol=1:3, Advil=4:6, Bayer=7:9, Generic=10:12)

答案 1 :(得分:14)

可以使用列表作为关联数组来定义brand -> product code映射,即:

brands <- list(Tylenol=1:3, Advil=4:6, Bayer=7:9, Generic=10:12)

一旦你有了这个,你可以反过来创建一个product code -> brand列表(可能需要大量的内存),或者只是使用搜索功能:

find.key <- function(x, li, default=NA) {
    ret <- rep.int(default, length(x))
    for (key in names(li)) {
        ret[x %in% li[[key]]] <- key
    }
    return(ret)
}

我确信有更好的方法来编写这个函数(for循环让我烦恼!),但至少它是矢量化的,所以它只需要一次遍历列表。

使用它会是这样的:

> dat$brand <- find.key(dat$product, brands)
> dat
   product   brand
1       11 Generic
2       11 Generic
3        9   Bayer
4        9   Bayer
5        6   Advil
6        1 Tylenol
7       11 Generic
8        5   Advil
9        7   Bayer
10      11 Generic
11       5   Advil
12      11 Generic
13       4   Advil
14       3 Tylenol
15      10 Generic
16       7   Bayer
17      10 Generic
18       5   Advil
19       9   Bayer
20       8   Bayer

recodelevels<-解决方案非常好,但它们也明显慢于此(并且一旦你有find.key这对于人类来说比{{1}更容易并且与recode)相同:

levels<-

(我无法让> microbenchmark( recode=recode(dat$product,recodes="1:3='Tylenol';4:6='Advil';7:9='Bayer';10:12='Generic'"), find.key=find.key(dat$product, brands), levels=`levels<-`(factor(dat$product),brands)) Unit: microseconds expr min lq median uq max 1 find.key 64.325 69.9815 76.8950 83.8445 221.748 2 levels 240.535 248.1470 274.7565 306.8490 1477.707 3 recode 1636.039 1683.4275 1730.8170 1855.8320 3095.938 版本正确地进行基准测试,但它似乎比上述所有版本更快,尽管对于人类而言比switch解决方案更糟糕。 )

答案 2 :(得分:12)

我喜欢recode包中的car函数:

library(car)

dat$brand <- recode(dat$product,
  recodes="1:3='Tylenol';4:6='Advil';7:9='Bayer';10:12='Generic'")

# > dat
#    product   brand
# 1       11 Generic
# 2       11 Generic
# 3        9   Bayer
# 4        9   Bayer
# 5        6   Advil
# 6        1 Tylenol
# 7       11 Generic
# 8        5   Advil
# 9        7   Bayer
# 10      11 Generic
# 11       5   Advil
# 12      11 Generic
# 13       4   Advil
# 14       3 Tylenol
# 15      10 Generic
# 16       7   Bayer
# 17      10 Generic
# 18       5   Advil
# 19       9   Bayer
# 20       8   Bayer

答案 3 :(得分:8)

我经常使用以下技术:

key <- c()
key[1:3] <- "Tylenol"
key[4:6] <- "Advil"
key[7:9] <- "Bayer"
key[10:12] <- "Generic"

然后,

> key[dat$product]
 [1] "Generic" "Generic" "Bayer"   "Bayer"   "Advil"   "Tylenol" "Generic" "Advil"   "Bayer"   "Generic"
[11] "Advil"   "Generic" "Advil"   "Tylenol" "Generic" "Bayer"   "Generic" "Advil"   "Bayer"   "Bayer"  

答案 4 :(得分:7)

“数据库方法”是为您的产品密钥定义保留一个单独的表(data.frame)。它更有意义,因为您说您的产品密钥不仅转化为品牌,还转化为大小:

product.keys <- read.table(textConnection("

product brand   size
1       Tylenol small
2       Tylenol medium
3       Tylenol large
4       Advil   small
5       Advil   medium
6       Advil   large
7       Bayer   small
8       Bayer   medium
9       Bayer   large
10      Generic small
11      Generic medium
12      Generic large

"), header = TRUE)

然后,您可以使用merge

加入您的数据
merge(dat, product.keys, by = "product")
#    product   brand   size
# 1        1 Tylenol  small
# 2        3 Tylenol  large
# 3        4   Advil  small
# 4        5   Advil medium
# 5        5   Advil medium
# 6        5   Advil medium
# 7        6   Advil  large
# 8        7   Bayer  small
# 9        7   Bayer  small
# 10       8   Bayer medium
# 11       9   Bayer  large
# 12       9   Bayer  large
# 13       9   Bayer  large
# 14      10 Generic  small
# 15      10 Generic  small
# 16      11 Generic medium
# 17      11 Generic medium
# 18      11 Generic medium
# 19      11 Generic medium
# 20      11 Generic medium

正如您所注意到的,merge不会保留行的顺序。如果这是一个问题,plyr包有一个join函数可以保留订单:

library(plyr)
join(dat, product.keys, by = "product")
#    product   brand   size
# 1       11 Generic medium
# 2       11 Generic medium
# 3        9   Bayer  large
# 4        9   Bayer  large
# 5        6   Advil  large
# 6        1 Tylenol  small
# 7       11 Generic medium
# 8        5   Advil medium
# 9        7   Bayer  small
# 10      11 Generic medium
# 11       5   Advil medium
# 12      11 Generic medium
# 13       4   Advil  small
# 14       3 Tylenol  large
# 15      10 Generic  small
# 16       7   Bayer  small
# 17      10 Generic  small
# 18       5   Advil medium
# 19       9   Bayer  large
# 20       8   Bayer medium

最后,如果您的表很大并且速度是个问题,请考虑使用data.tables(来自data.table包)而不是data.frames。

答案 5 :(得分:6)

这个需要一些打字,但如果你真的有一个庞大的数据集,这可能是要走的路。在talkstats.com上的Bryangoodrich和Dason教会了我这个。它使用哈希表或创建包含查找表的环境。我实际上将这个保留在我的.Rprofile(哈希函数)上,用于字典类型查找。

我将您的数据复制1000次以使其更大一些。

#################################################
# THE HASH FUNCTION (CREATES A ENW ENVIRONMENT) #
#################################################
hash <- function(x, type = "character") {
    e <- new.env(hash = TRUE, size = nrow(x), parent = emptyenv())
    char <- function(col) assign(col[1], as.character(col[2]), envir = e)
    num <- function(col) assign(col[1], as.numeric(col[2]), envir = e)
    FUN <- if(type=="character") char else num
    apply(x, 1, FUN)
    return(e)
}
###################################
# YOUR DATA REPLICATED 1000 TIMES #
###################################
dat <- dat <- structure(list(product = c(11L, 11L, 9L, 9L, 6L, 1L, 11L, 5L, 
    7L, 11L, 5L, 11L, 4L, 3L, 10L, 7L, 10L, 5L, 9L, 8L)), .Names = "product", row.names = c(NA, 
    -20L), class = "data.frame")
dat <- dat[rep(seq_len(nrow(dat)), 1000), , drop=FALSE]
rownames(dat) <-NULL
dat
#########################
# CREATE A LOOKUP TABLE #
#########################
med.lookup <- data.frame(val=as.character(1:12), 
    med=rep(c('Tylenol', 'Advil', 'Bayer', 'Generic'), each=3))  

########################################
# USE hash TO CREATE A ENW ENVIRONMENT #
########################################  
meds <- hash(med.lookup)  

##############################
# CREATE A RECODING FUNCTION #
##############################          
recoder <- function(x){
    x <- as.character(x) #turn the numbers to character
    rc <- function(x){
       if(exists(x, env = meds))get(x, e = meds) else NA 
    }  
    sapply(x, rc, USE.NAMES = FALSE) 
}
#############
# HASH AWAY #
#############
recoder(dat[, 1])    

在这种情况下,散列很慢但是如果你有更多的重新编码级别,那么它的速度会比其他级别提高。

答案 6 :(得分:3)

比嵌套ifelse更具可读性:

unlist(lapply(as.character(dat$product), switch,
              `1`=,`2`=,`3`='tylenol',
              `4`=,`5`=,`6`='advil',
              `7`=,`8`=,`9`='bayer',
              `10`=,`11`=,`12`='generic'))
警告:效率不高。

答案 7 :(得分:2)

我倾向于使用这个功能:

recoder <- function (x, from = c(), to = c()) {
  missing.levels <- unique(x)
  missing.levels <- missing.levels[!missing.levels %in% from]
  if (length(missing.levels) > 0) {
    from <- append(x = from, values = missing.levels)
    to <- append(x = to, values = missing.levels)
  }
  to[match(x, from)]
}

如:

recoder(x = dat$product, from = 1:12, to = c(rep("Product1", 3), rep("Product2", 3), rep("Product3", 3), rep("Product4", 3)))

答案 8 :(得分:1)

如果您在序列组中有代码,如示例中所示,这可能是cut芥末:

cut(dat$product,seq(0,12,by=3),labels=c("Tylenol","Advil","Bayer","Generic"))
 [1] Generic Generic Bayer   Bayer   Advil   Tylenol Generic Advil   Bayer  
[10] Generic Advil   Generic Advil   Tylenol Generic Bayer   Generic Advil  
[19] Bayer   Bayer  
Levels: Tylenol Advil Bayer Generic

答案 9 :(得分:0)

还有arules:discretize,但我更喜欢它,因为它会让你将标签与值范围区分开来:

library(arules)
discretize( dat$product, method = "fixed", categories = c( 1,3,6,9,12 ), labels = c("Tylenol","Advil","Bayer","Generic") )

[1] Generic Generic Generic Generic Bayer   Tylenol Generic Advil   Bayer   Generic Advil   Generic Advil   Advil   Generic Bayer   Generic Advil   Generic Bayer  
Levels: Tylenol Advil Bayer Generic

答案 10 :(得分:0)

为了完整性(可能是最快和最简单的解决方案),可以创建并命名向量并将其用于查找。 信用:http://adv-r.had.co.nz/Subsetting.html#applications

product.code <- c(1='Tylenol', 2='Tylenol', 3='Tylenon', 4='Advil', 5 ='Advil', 6='Advil', 7='Bayer', 8='Bayer', 9='Bayer', 10='Generic', 11='Generic', 12='Generic')

获取输出

$unname(product.code[dat$product])

使用顶级解决方案提高速度的基准

$microbenchmark(
 named_vector = unname(product.code[dat$product]), 
 find.key = find.key(dat$product, brands),
 levels = `levels<-`(factor(dat$product),brands))
Unit: microseconds
         expr     min       lq      mean   median       uq     max neval
 named_vector  11.777  20.4810  26.12832  23.0410  28.1610 207.360   100
     find.key  34.305  55.8090  58.75804  59.1370  65.5370 130.049   100
       levels 143.361 224.7685 234.02545 247.5525 255.7445 338.944   100

此解决方案与@ kohske的解决方案非常相似,但适用于非数字查找。

答案 11 :(得分:0)

在这种情况下可以使用的另一个版本:

c("Tylenol","Advil","Bayer","Generic")[(dat$product %/% 3.1) + 1]