什么是“ - ;”意味着在bash声明结束时？

Question

例如

bwa sampe ref.fa r1.sai r2.sai r1.fq r2.fq | samtools view -bSho out.bam -;

“ - ;”的目的是什么？最后的人物？他们在做什么？为什么他们有必要？

Answer 1

分号结束命令（结束管道，我相信，从技术上说是正确的说法）。如果您愿意，可以使用其他命令跟随它，如

bwa sampe ref.fa r1.sai r2.sai r1.fq r2.fq | samtools view -bSho out.bam -; echo Here is another command.

否则，分号是无害的，但可能是不必要的。

关于分号前面的-连字符，对于samtools和许多其他命令，它意味着使用标准输入代替输入文件（或者，在某些情况下，标准输出代替输出文件）。这是典型的Linux / Unix用法。

（感谢@phatfingers验证samtools命令的用法。）