Question

我是R的新手，我正在尝试将R与MySQL连接。我为64位安装了mysql-5.5.22-winx64和R-2.12.0。我已设置MYSQL_HOME environment path(C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5)并尝试按照以下步骤操作：

从此处安装最新的RTool
安装MySQL或mysql的头文件和库文件
创建或编辑文件C:\Program Files\R\R-2.12.1\etc\Renviron.site并添加MYSQL_HOME=C:/mysql之类的行（mysql文件的路径）
将libmysql.lib从mysql/lib复制到mysql/lib/opt以符合相关性。
将libmysql.dll复制到C:\Program Files\R\R-2.12.1\bin或windows/system32 directory。

运行install.packages('RMySQL',type='source')并等待编译结束。但我仍然得到这个错误： -

*> install.packages('RMySQL',type='source')
 --- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
 trying URL 'http://ftp.iitm.ac.in/cran/src/contrib/RMySQL_0.9-3.tar.gz'
 Content type 'application/x-gzip' length 165363 bytes (161 Kb)
 opened URL
 downloaded 161 Kb

* installing *source* package 'RMySQL' ...
ERROR: configuration failed for package 'RMySQL'
* removing 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL'
* restoring previous 'C:/PROGRA~1/R/R-212~1.0/library/RMySQL'

 The downloaded packages are in
  ‘C:\Users\sharad\AppData\Local\Temp\RtmpdQHwCb\downloaded_packages’
 Warning message:
      In install.packages("RMySQL", type = "source") :
installation of package 'RMySQL' had non-zero exit status*

请建议我如何解决这个问题？

最后我得到了解决方案： - 您可以在我的blog上详细查看解决方案。

我在使用RMySQL包安装R的最后2天工作，最后得到了解决方案，以下是安装RMySQL包的步骤： -

从以下链接下载软件：

   * a. R2.13.2:  Download R from http://cran.stat.sfu.ca/index.html

    b. RTools 214:  Download RTools from http://cran.cict.fr

    c. RMySQL 0.8-0.tar.gz: Download RMySQL from 
     http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/main/RMySQL/RMySQL_0.8-0.tar.gz

    d. MySQL Server 5.0: download it from http://dev.mysql.com

    e. RSTUDIO (optional): download it from http://rstudio.org*

设定以下环境变量

    * a. MYSQL_HOME : <drive>/path to MySQL installation folder
         e.g. MYSQL_HOME= C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\  

      b. R_HOME: <drive>/path to R installation
         e.g. R_HOME=C:\Program Files\R\R-2.13.2\

       c. PATH: Modify path to accommodate the above variables. *

确保Windows PATH变量中包含以下路径： \ Rtools \ 2.14 \仓 \ Rtools \ 2.14 \ MinGW的\ BIN \ Rtools \ 2.14 \ MinGW64 \ BIN

创建文件夹和复制文件
```
    * a. OPT: Create a folder OPT under
             C:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.5\lib and
         copy MYSQLLIB.LIB  the above path.
       Also copy libmysql.dll to
              <drive>\<path>\R\R-2.14.0\bin\(64 bit) Or
              <Drive>\<path>\R\R-2.14.0\bin\i386\ (32 bit) and
         to C:\Windows\System32.

      b. Renviron.site: create or edit a file 
              <DRIVE>\<path>\R\R-2.14.0\etc\Renviron.site and 
        add a line: 
          MYSQL_HOME =”C:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.5/”
        NB: USE FORWARD SLASH AND DOUBLE QUOTES HERE

      c. libMySQL.dll: Copy this file to
            C:\Program Files\R\R-2.13.2\bin\i386 as well as
            C:\Program Files\R\R-2.13.2\bin*
```
1. RUN COMMANDS
  
  一个。 Install.Packages：通过单击桌面上的R图标或从“开始”菜单运行R GUI。类型           INSTALL.PACKAGES（“RMySQL”，类型=”源”）。      这将从存储库下载所需的软件。
  
  湾命令提示符：复制下载的zip文件（在步骤4.a.中）并将其粘贴到R安装文件夹下。       转到“开始”菜单并打开“命令提示符”。转到R安装文件夹，然后键入R CMD INSTALL RMySQL_0.8-0.tar.gz
  
  *命令：
  
  
  库（RMySQL）   drv = dbDriver（＆＃34; MySQL＆＃34;）   con = dbConnect（drv，host =＆＃34; localhost＆＃34;，dbname =＆＃34; test＆＃34;，user =＆＃34; root＆＃34;，pass =＆＃34; root＆＃34;）   album = dbGetQuery（con，statement =＆＃34; select * from t_master＆＃34;）   专辑*

Answer 1

您现在可以跳过所有复杂的步骤，只需执行install.packages("RMySQL")

Answer 2

周末我在Mac OSX上遇到黑客马拉松时遇到了这个问题 - 尽管有一些参考资料（最后提到），但我花了4个小时将所有东西拼凑在一起。我没有找到一个简单的演练，所以我决定发布一个，但它在我心中是新的。

我不确定与Windows的兼容性，但希望这些说明也会让您更轻松。

我试图让R和MySQL在本地环境中进行通信（可能需要对服务器环境进行更改）。我使用XAMPP（虽然我没有使用RMySQL进行连接），但最后我能够使用PHP页面编写R文件，执行该文件，并将R写入MySQL表。据我所知，这仅适用于MacOSX ...

所有使用的软件均采用dmg格式，因此无需二进制安装。

Download R并运行一些基本命令以确保您有效。
在R中，您需要安装RODBC（如果您还没有）。在R控制台中输入此内容。

install.packages("RODBC")

这会安装RODBC，但自从OS Mavericks以来，某些文件不再包含在内，因此您收到错误消息

未找到ODBC标头sql.h和sqlext.h

你需要在正确的位置获取sql.h和sqlext.h文件。

要以最简单的方式执行此操作，请确保已安装homebrew（简单说明）。然后在终端中使用此code进行安装。

完成后，再次进入R控制台

install.packages("RODBC")

搜索MySQL for the appropriate ODBC installation。我正在运行Mac OSX 10.6，所以我下载了dmg并安装了它。这样可以解决问题。
现在是棘手的部分。显然，Mac OX在最近的操作系统发布后取出了ODBC管理器，因此您需要下载ODBC管理器（http://www.odbcmanager.net/）。它也是一个dmg文件，所以只需拖放到您的实用程序文件夹即可。

我在5.3.6 dmg安装时遇到了困难（保持失败），所以我安装了5.2.7。

打开ODBC管理器。您需要配置DSN，因此请单击“系统DSN”选项卡，然后单击“添加”。
您将看到一个弹出窗口，要求您选择一个驱动程序。我有基于MySQL ODBC安装的“MySQL ODBC 5.2 Driver”。单击“确定”。如果您没有看到驱动程序，则需要确认已安装MySQL ODBC。
在下一个弹出窗口中，根据需要创建数据源名称（DSN） - 但请记住，这是您从R调用时需要使用的名称。在下面的关键字区域（关键字将在引号和值将在括号中），ADD

“database”（包含数据库名称的值）

“server”（对于本地环境不使用localhost - 而是使用本地IP地址127.0.0.1。***这是我的关键部分）

“uid”（数据库用户ID）

“pwd”（数据库密码）

“socket”（不确定这是否是必需的，但经过多次教程之后，它留在我的配置中并且工作正常，所以也许你需要它。你可以在my.cnf找到你的套接字位置 - 做一个聚光灯搜索。套接字文件位置在CLIENT）下

以下是我的配置：

DSN（“测试” - 这是在顶部）

数据库（“电视”）

socket（“/Applications/XAMPP/xamppfiles/var/mysql.sock”）

uid（“root”）

pwd（“”）

服务器（“127.0.0.1”）
在R中，执行以下内容 - 我相信每次启动R并在进行MySQL查询之前，都需要完成最后3个步骤。

库（RODBC）
确保您已从XAMPP控制面板启用了MySQL和Apache。
然后执行

odbcConnect（“test”） - 注意我在双引号中使用DSN的方式。必要时互换。

这应该让你开始运行。您可以阅读有关在R中进行MySQL查询的其他教程。

我从Stack Overflow上的很多精彩帖子（感谢所有人！），随机的其他网站/电子邮件交换历史以及Joseph Adler的“R In A Nutshell”一书中共同攻击了这一点，但如果我错过了，请告诉我某事或不清楚。

Answer 3

我还花了几个小时试图在Windows 10中完成这项工作，从而出现错误。我发现RMySQL的修复程序既凌乱又复杂，但RODBC更加轻松，优雅地导致了解决方案。我有R，RStudio，MySQL服务器，MySQL Workbench，并且需要以下额外步骤才能使其工作：

在RStudio install.packages(RODBC)
下载并安装MySQL ODBC连接器here
配置MySQL ODBC连接器。 Here是一些说明。只需在Windows 10的开始屏幕上搜索“ODBC”，它就会弹出该窗口。获取正确的连接参数并使用测试按钮确保它正常工作。它连接后会在下拉菜单中显示您的数据库列表。在“数据源名称”中给它一个名称，它将进入R脚本，比如'mysql_odbc'

现在您可以连接，运行查询并断开连接：

library(RODBC)
cursor <- odbcConnect("mysql_odbc", uid="root", pwd="HaysPuffyWalton5")
out <- sqlQuery(cursor, "SELECT * FROM emp WHERE deptno = 10");
close(cursor);

Answer 4

这不是一个直接的答案，但你仍然觉得它很有帮助：

使用更新版本的R（目前为2.15）
在Windows平台上，我宁愿使用RODBC + Windows MySQL驱动程序，除非您处于具有异构平台（即Linux和Windows）的环境中，其中代码在团队成员之间共享。甚至然后在相同的脚本中选择使用RMySQL和RODBC，具体取决于它运行的平台是一个简单的if() {...} else {...}

请注意，我并不是说没有成功案例可以解决您的问题，但恕我直言，您将会更快地启动并运行上述内容。

Answer 5

这对我有用：使用Windows XP SP3 32位操作系统，R Studio，Rv2.15.3

按照以下说明操作：http://biostat.mc.vanderbilt.edu/wiki/Main/RMySQL

但是，如果您已下载MySQL版本5.6，则必须复制libmysql.lib存在于此路径中：D:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6\lib并创建一个新文件夹，如：D:\Program Files\MySQL\MySQL Server 5.6\lib\opt并粘贴libmysql.lib文件夹中的opt以上。然后Renviron.site文件将包含：MYSQL_HOME=D:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6。请注意正斜杠。

最后按照上面链接中提供的install.packages行的说明进行操作。我不得不做一些试验才能最终得到它。

Answer 6

如果这是R中的错误

library(RMySQL)
#-----------
Loading required package: DBI

Error : .onLoad failed in loadNamespace() for 'RMySQL', details

  call: i$Location

  error: $ operator is invalid for atomic vectors

Error: package or namespace load failed for 'RMySQL'

然后从外面R

set MYSQL_HOME=F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6

AND BACK INSIDE：

library(RMySQL)

#Loading required package: DBI
#MYSQL_HOME defined as F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6

或者只是来自内部R

Sys.setenv(MYSQL_HOME = "F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6")
library(RMySQL)

#Loading required package: DBI
#MYSQL_HOME defined as F:/Program Files/MySQL/MySQL Server 5.6

Answer 7

按照指南：

http://www.ahschulz.de/2013/07/23/installing-rmysql-under-windows/

我跟着它，它就像一个魅力。：）

如何连接R与MySQL或如何安装RMySQL包？

7 个答案: