Question

我自己努力制作一个r包。我在how to develop package for layman上的stackoverflow中按照上一个问题中的说明进行操作。以下是我按照上一个问题工具的步骤。

在新R会话中运行R代码

# random DNA function
randDNA = function(n){
paste(sample(c("A", "C", "T", "G"), n, replace = TRUE), collapse = "")
}
# DNA to RNA function
dna2rna <- function(inputStr) {
  if (!is.character(inputStr))
    stop("need character input")
  is = toupper(inputStr)
  chartr("T", "U", is)
}

# complementary sequence function
compSeq <-  function(inputStr){
 chartr("ACTG", "TGAC", inputStr)
 }

# example data
dnaseq1 <- c("ATTGTATCTGGGTATTTCCCTTAATTGGGGCCTTT")
dnaseq2 <- c("TGGGGTAAACCCGGTTTAAAATATATATATTTTT")
myseqdata <- data.frame(dnaseq1, dnaseq2)
save(myseqdata, file = "myseqdata.RData")

安装Rtools安装R包utils

Pe来自R

中的以下任务

require(utils)
package.skeleton(list = c("randDNA","dna2rna", "compSeq", "myseqdata"), 
name = "dnatool",environment = .GlobalEnv, path = "c:", force = FALSE)

在Windows 7中编辑以下系统环境变量路径
```
C:\Rtools\bin;C:\Rtools\perl\bin;C:\Rtools\MinGW\bin; 
C:\Program Files\R\R-2.14.2\bin\x64; 
```
（在命令行中键入>path以检查路径是否已正确设置。
在步骤（3）中复制文件夹dnatool并输入名为rpackage的新文件夹，现在将目录更改为此文件夹（在DOS中）
```
c: \ repackage>  R CMD build dnatool 
c: \ repackage>  Rcmd build dnatool 
```
编辑：我有时会得到dnatool.zip，但有时候dnatool.tar.gx
在命令行（DOS）中检查包
```
c: \ repackage> R CMD check dnatool
```

我能够在Windows中将其打包为“dnatool.zip”。

如何编译MAC或unix源？哪些步骤有所不同？

Unix source:     dnatool.tar.gz
Mac OS X binary: dnatool.tgz

我需要Mac电脑吗？我有linux virtualbox并安装了ubuntu吗？

编辑：

我应该使用以下commad得到从步骤sourcode二进制（3）夹dnatool？

$ tar -zcvf dnatool.tar.gz/home/dnatool

Answer 1

使用R CMD build创建的包可以安装在其他操作系统类型上。即使您的软件包包含R（c或c ++）以外的源代码，也是如此。只有在创建二进制分发时（我认为通过在r cmd构建调用中添加--binary），包才会变为特定于平台。构建软件包所需的工具通常已经安装在linux或mac下。因此，如果您创建源分发，它应该在所有主要发行版下工作。要创建mac二进制文件，您需要一个mac，或者创建一个交叉编译器环境。第二种选择可能是一个很大的挑战，我说你可以给谷歌。请注意，如果您将包上传到CRAN，则会为您完成所有包的构建。

在Windows / Linux中为Mac创建包

1 个答案: