我的想法是,每次每个节点映射一个巨大文件的一个块并处理它。然后它将这个块发送出去,然后去找下一个。
但是,我总是在群集(Openmpi)上失败但在我的机器上运行正常(mpich)
映射部分如下: PAGE是一个整数= 4 * 1000 * 1000 //偏移量必须是一个内存页面的次数,即4kb。 ntask是节点的总数 mytask表示当前节点号 所以缓冲区大小设置为总数/节点数(statbuf.st_size / ntask)
char *
mmaping (char *source)
{
int src;
char *sm;
struct stat statbuf;
if ((src = open (source, O_RDONLY)) < 0)
{
perror (" open source ");
exit (EXIT_FAILURE);
}
if (fstat (src, &statbuf) < 0)
{
perror (" fstat source ");
exit (EXIT_FAILURE);
}
sm = mmap (0,(long long)statbuf.st_size/ntask, PROT_READ, MAP_SHARED | MAP_NORESERVE,src, mytask*share*PAGE);
if (MAP_FAILED == sm)
{
perror (" mmap source ");
exit (EXIT_FAILURE);
}
printf("length->%d\n",strlen(sm));
return sm;
}
error msg
[kalkyl3:15871] *** Process received signal ***
[kalkyl3:15871] Signal: Segmentation fault (11)
[kalkyl3:15871] Signal code: Address not mapped (1)
有人能给我一些建议吗?
答案 0 :(得分:0)
由于对mark a comment as an answer的功能请求仍然被拒绝,我在此处复制上述解决方案。
您应该调用getpagesize()而不是假设4kB页面。在任何情况下,千字节都是1024字节,而不是1000字节。您确定文件中每个共享* PAGE大小的块末尾都有一个空字节吗?因为如果没有,strlen将会愉快地跑过mmaped区域的末端和段错误。 - Greg Inozemtsev