从bash变量中提取数字

Question

我有这段代码：

for a in `ls *w.txt`; do perl getSequenceNs.pl $a /home/prenos/medicago/${a:0:1}.NOLE.fas >sequences/${a}_sequence.txt; done

除非我认识到，$ {a：0：1}从$ a中提取第一个数字并且不幸的是有时有两个数字，它一直运作得很好。

所以，我的变量$ a包含：

dsomeletters <-one digit and letters, for example 1.NOLE.fas

ddsomeletters <-two digits and letters, for example 12.NOLE.fas

如何只提取数字？我应该如何修改我的代码（我应该使用什么而不是${a:0:1}）？

Answer 1

${a//[^0-9]*} 

应该做你想做的事。这实际上是一种基础，所以你可能更喜欢便携式：

${a%%[^0-9]*}

Answer 2

首先，不要解析ls，只有glob会做并正确处理丑陋的字符。现在，您可以使用bash字符串操作来获取数字：

$ var=123abc456def
$ echo ${var%%[^0-9]*}
123
$ echo ${var//[^0-9]*/}
123

请注意*这里不是通常的0+重复，而是全局的。两种模式都从第一个不是数字的字符移到字符串的末尾。所以你的最终命令应如下所示：

for a in *w.txt; do perl getSequenceNs.pl "$a" /home/prenos/medicago/${a%%[^0-9]*}.NOLE.fas >"sequences/${a}_sequence.txt"; done

Answer 3

文件名的字母部分是否始终一致？如果是这样，您可以使用basename：

来避免此问题

NAME=`basename $a .NOLE.fas`