从Hadoop中的reduce步骤处理大输出值

时间:2012-04-13 11:44:25

标签: java memory hadoop mapreduce stringbuilder

在我的MapReduce程序的Reduce阶段,我正在执行的唯一操作是将所提供的Iterator中的每个值连接起来,如下所示:

public void reduce(Text key, Iterator<text> values,
                    OutputCollector<Text, Text> output, Reporter reporter) {
    Text next;
    Text outKey = new Text()
    Text outVal = new Text();
    StringBuilder sb = new StringBuilder();
    while(values.hasNext()) {
        next = values.next();
        sb.append(next.toString());
        if (values.hasNext())
            sb.append(',');
    }
    outKey.set(key.toString());
    outVal.set(sb.toSTring());
    output.collect(outKey,outVal);
}

我的问题是某些reduce输出值是巨大的行文本;如此大,即使初始大小非常大,字符串缓冲区也必须增加(加倍)它的大小几次才能容纳迭代器的所有上下文,从而导致内存问题。

在传统的Java应用程序中,这表明对文件的缓冲写入将是写入输出的首选方法。如何在Hadoop中处理极大的输出键值对?我应该将结果直接流式传输到HDFS上的文件(每个reduce调用一个文件)吗?有没有办法缓冲输出,除了output.collect方法?

注意:我已经尽可能地增加了内存/堆。此外,有几个消息来源表示增加reducer的数量有助于解决内存/堆问题,但这里的问题直接追溯到SringBuilder在扩展容量时的使用。

由于

2 个答案:

答案 0 :(得分:3)

不是我理解为什么你想要一个巨大的价值,但有一种方法可以做到这一点。

如果您编写自己的OutputFormat,则可以修复RecordWriter.write(Key, Value)方法的行为,以根据Key值是否为null来处理值连接。

这样,在reducer中,您可以按如下方式编写代码(密钥的第一个输出是实际密钥,之后的所有内容都是空密钥:

public void reduce(Text key, Iterator<Text> values,
                OutputCollector<Text, Text> output, Reporter reporter) {
  boolean firstKey = true;
  for (Text value : values) {
    output.collect(firstKey ? key : null, value);
    firstKey = false;
  }
}

实际的RecordWriter.write()具有以下逻辑来处理空键/值连接逻辑:

    public synchronized void write(K key, V value) throws IOException {

        boolean nullKey = key == null || key instanceof NullWritable;
        boolean nullValue = value == null || value instanceof NullWritable;
        if (nullKey && nullValue) {
            return;
        }

        if (!nullKey) {
            // if we've written data before, append a new line
            if (dataWritten) {
                out.write(newline);
            }

            // write out the key and separator
            writeObject(key);
            out.write(keyValueSeparator);
        } else if (!nullValue) {
            // write out the value delimiter
            out.write(valueDelimiter);
        }

        // write out the value
        writeObject(value);

        // track that we've written some data
        dataWritten = true;
    }

    public synchronized void close(Reporter reporter) throws IOException {
        // if we've written out any data, append a closing newline
        if (dataWritten) {
            out.write(newline);
        }

        out.close();
    }

你会注意到close方法也被修改为写下最后一条记录的尾随换行符

完整的代码清单可以在pastebin找到,这是测试输出:

key1    value1
key2    value1,value2,value3
key3    value1,value2

答案 1 :(得分:2)

如果单个输出键值可以大于内存,则意味着标准输出机制不适合 - 因为,通过inerface设计,它需要传递键值对而不是流。
我认为最简单的解决方案是将输出流式传输到HDFS文件。
如果您有理由通过输出格式传递数据 - 我建议采用以下解决方案: a)写入当地临时目录
b)将文件名作为输出格式的值传递。

最有效但有点复杂的解决方案是使用内存映射文件作为缓冲区。只要有足够的内存,它就会在内存中,并且在需要时,操作系统会关心磁盘的高效溢出。