使用cron安排R脚本

Question

我正在尝试使用cron安排我的R脚本，但它无法正常工作。看来R在cron中找不到包。有人可以帮帮我吗？感谢。

以下是我的bash脚本

# source  my profile
. /home/winie/.profile
# script.R will load packages
R CMD BATCH /home/script.R 

Answer 1

考虑这些提示

1. 使用Rscript（或更小）而不是R CMD BATCH

2. 确保cron作业正在运行

3. 确保脚本自行运行

4. 在详细模式下测试几次

我的框通过调用R脚本的cronjob运行有点可见的CRANberries （我通过littler执行但是Rscript 也应该工作）。为此，我的Ubuntu服务器上的/etc/crontab中的条目是

# every few hours, run cranberries
16 */3 * * *    edd     cd /home/edd/cranberries && ./cranberries.r

所以每隔三个小时过去十六分钟，我的id就会运行一个shell命令。它将更改为工作目录，并调用R脚本（具有可执行模式等）。

看着这个，我实际上只是运行脚本并在其中有setwd()命令....