Question

如何在R开始新的knitr会话？我宁愿开始一个新的会话，而不是像rm(list=ls())那样使用它，因为它不等同。

<<myname>>=
#some R code
@
<<another_chunk>>=
#start a new R session
#more R code
@

Answer 1

好的，现在我有一些更实质的东西，受到an answer on the R-help list by Georg Ruß的启发。他建议让R回到启动时的三个方面，我已经为你写了这个六步手册。

首先，保存一个在启动时运行的软件包的字符串（在运行任何其他代码之前，应该先执行其他操作），

foo <- .packages()

其次，当您想要重置R时，如您所述，您运行

rm(list=ls())

删除所有对象。然后，第三，你跑，

bar <- .packages()

获取当前包的字符串。接下来，

foobar <- setdiff(bar, foo)

第五，你通过这种解决方法循环消除差异，

toRemove <- paste("package:", foobar, sep='') 
#or paste0("package:", foobar) in R-2.15.0 or higher
for(i in seq_along(foobar)) {           
    detach(toRemove[i], character.only=TRUE)    
}

第六，根据您的设置，您可以获得.Rprofile

source(".Rprofile")

这应该将R置于启动时的状态。我本可以忽视一些事情。

Answer 2

我不建议在knitr中启动新的R会话，而是建议您在终端（或命令窗口）中启动一个新的R会话，如下所示：

R -e "library(knitr); knit('your_input.Rnw')"

如果你在Windows下，你必须将R的bin目录放入你的环境变量PATH（我已经厌倦了描述如何做到这一点，所以如果你在Windows世界，或查看LyX Sweave manual）。

但是，大多数编辑在调用Sweave或knitr时会启动新的R会话，例如LyX和RStudio等您可以在http://yihui.name/knitr/demo/editors/中找到更多可能的编辑器。我真的不需要在终端中调用R -e ...。

在knitr中开始一个新的R会话

2 个答案: