Question

我有一个bash脚本，用于设置环境变量并运行命令

LD_LIBRARY_PATH=my_path
sqsub -np $1 /homedir/anotherdir/executable

现在我想使用python而不是bash，因为我想计算一些我传递给命令的参数。

我试过了

putenv("LD_LIBRARY_PATH", "my_path")

和

call("export LD_LIBRARY_PATH=my_path")

接着是

call("sqsub -np " + var1 + "/homedir/anotherdir/executable")

但是程序总是放弃，因为没有设置LD_LIBRARY_PATH。

我该如何解决这个问题？

感谢您的帮助！

（如果我在调用python脚本之前导出LD_LIBRARY_PATH一切正常，但我希望python确定路径并将环境变量设置为正确的值）

Answer 1

击：

LD_LIBRARY_PATH=my_path
sqsub -np $1 /path/to/executable

类似，在Python中：

import os
import subprocess
import sys

os.environ['LD_LIBRARY_PATH'] = "my_path" # visible in this process + all children
subprocess.check_call(['sqsub', '-np', sys.argv[1], '/path/to/executable'],
                      env=dict(os.environ, SQSUB_VAR="visible in this subprocess"))

Answer 2

您可以使用

向环境中添加元素

os.environ['LD_LIBRARY_PATH'] = 'my_path'

使用

在shell（使用os.environ）中运行子进程

subprocess.call('sqsub -np ' + var1 + '/homedir/anotherdir/executable', shell=True)

Answer 3

这里有很多好的答案，但是您应该不惜一切代价避免使用shell=True将不受信任的变量传递给子流程，因为这是安全隐患。变量可以转义到shell并运行任意命令！如果您无法避免，请至少使用python3的shlex.quote()来转义字符串（如果您有多个以空格分隔的参数，请用每个分隔符代替完整的字符串）。

shell=False始终是传递参数数组的默认设置。

现在安全解决方案...

方法＃1

更改您自己的进程的环境-新的环境将应用于 python本身和所有子进程。

os.environ['LD_LIBRARY_PATH'] = 'my_path'
command = ['sqsub', '-np', var1, '/homedir/anotherdir/executable']
subprocess.check_call(command)

方法2

复制环境，然后将其传递给孩子。您可以完全控制子环境，并且不会影响python自己的环境。

myenv = os.environ.copy()
myenv['LD_LIBRARY_PATH'] = 'my_path'
command = ['sqsub', '-np', var1, '/homedir/anotherdir/executable']
subprocess.check_call(command, env=myenv)

方法＃3

仅Unix：执行env来设置环境变量。如果您要修改的变量很多而不是portabe，则比较麻烦。但是像＃2一样，您可以完全控制python和子级环境。

command = ['env', 'LD_LIBRARY_PATH=my_path', 'sqsub', '-np', var1, '/homedir/anotherdir/executable']
subprocess.check_call(command)

当然，如果var1包含多个以空格分隔的参数，则它们现在将作为带有空格的单个参数传递。要保留shell=True的原始行为，必须组成一个包含分割字符串的命令数组：

command = ['sqsub', '-np'] + var1.split() + ['/homedir/anotherdir/executable']

Answer 4

紧凑型解决方案（假设您不需要其他环境变量）：

call('sqsub -np {} /homedir/anotherdir/executable'.format(var1).split(),
      env=dict(LD_LIBRARY_PATH=my_path))

使用env命令行工具：

call('env LD_LIBRARY_PATH=my_path sqsub -np {} /homedir/anotherdir/executable'.format(var1).split())

在python脚本中设置环境变量

4 个答案:

方法＃1

方法2

方法＃3