Question

以下代码导致Java出现段错误：

import os.path
import neo4j
from paste import httpserver, fileapp
import tempfile
from webob.dec import wsgify
from webob import Response, Request

HOST = '127.0.0.1'
PORT = 8080

class DebugApp(object):
    @wsgify
    def __call__(self, req):

        # db = neo4j.GraphDatabase(tempfile.mkdtemp())
        db = neo4j.GraphDatabase(os.path.join(os.path.dirname(os.path.abspath(__file__)), 'data'))
        return Response(body='it worked')

def main():
    app = DebugApp()
    httpserver.serve(app, host=HOST, port=PORT)

if __name__ == '__main__':
    main()

要重现，首先将该代码保存到文件中（例如，app.py），然后运行python app.py。然后在浏览器中尝试http://localhost:8080;你应该看到Java崩溃处理程序。

Java堆栈跟踪的顶部如下所示：

Stack: [0xb42e7000,0xb4ae8000],  sp=0xb4ae44f0,  free space=8181k
Native frames: (J=compiled Java code, j=interpreted, Vv=VM code, C=native code)
C  [_jpype.so+0x26497]  JPJavaEnv::NewObjectA(_jclass*, _jmethodID*, jvalue*)+0x37
C  [_jpype.so+0x3c0e8]  JPMethodOverload::invokeConstructor(_jclass*, std::vector<HostRef*, std::allocator<HostRef*> >&)+0x178
C  [_jpype.so+0x3a417]  JPMethod::invokeConstructor(std::vector<HostRef*, std::allocator<HostRef*> >&)+0x47
C  [_jpype.so+0x1beba]  JPClass::newInstance(std::vector<HostRef*, std::allocator<HostRef*> >&)+0x2a
C  [_jpype.so+0x67b9c]  PyJPClass::newClassInstance(_object*, _object*)+0xfc
C  [python+0x96822]  PyEval_EvalFrameEx+0x4332
C  [python+0x991e7]  PyEval_EvalCodeEx+0x127

我相信Python中的neo4j.GraphDatabase触发JPype在Java下在neo4j中寻找EmbeddedGraphDatabase。

在交互式Python会话中运行此代码不会出现段错误：

>>> import webob
>>> import app
>>> debug_app = app.DebugApp()
>>> response = debug_app(webob.Request.blank('/'))
>>> response.body
'it worked'

据推测那是因为我在这个例子中完全避免使用Paste。也许这与Paste使用线程妨碍neo4j有关？我在neo4j论坛中注意到一个类似的问题：http://neo4j-community-discussions.438527.n3.nabble.com/Neo4j-CPython-Pylons-and-threading-td942435.html

...但这只会在关机时发生。

Answer 1

问题不是使用Paste本身，而是使用使用JPype的neo4j Python绑定。粘贴创建线程来处理传入的请求; neo4j应该是线程安全的，但是JPype在文档（1）中附带了这个警告：

“在大多数情况下，基于操作系统级别线程（即posix线程）的python线程将毫无问题地工作。唯一要记住的是在线程主体中调用jpype.attachThreadToJVM（）以使JVM可用于对于你自己没有开始的线程，你可以调用isThreadAttachedToJVM（）进行检查。“

我找不到执行此操作的代码，但我认为neo4j绑定中的某些Java代码可能会在导入时调用attachThreadToJVM。如果是这样，当通过粘贴将请求传递给工作线程，然后该线程从neo4j获取数据时，它将越过线程边界，并且可能不满足JVM附件规则。

只需在单个线程中运行import neo4j即可避免崩溃。在上面的情况中，这是threading.Thread所针对的可调用对象。

不幸的是，这意味着即使neo4j是线程安全的，但是当从Python使用时，它必须被约束为单个线程。但考虑到这一点并不太令人失望。

更新：维护人员回复了（2）并调查了问题，并检查了修复程序。我不知道哪个版本的neo4j可用，并且我再也找不到它们的github repo（3）的提交，所以这代表重新测试。

为什么在粘贴应用程序中创建neo4j.GraphDatabase会导致段错误？

1 个答案: