for for循环中的循环?

时间:2011-08-02 07:31:31

标签: r loops for-loop dataframe for-in-loop

我有两个数据帧:

df1<- as.data.frame(matrix(1:15, ncol=5))
df2<- as.data.frame(matrix(30:44,ncol=5))

通过使用我想要计算zscore的两个数据帧。功能是:

z = (X - u)/ O

df1包含所有X值,df2数据帧的每一行包含用于计算均值和sd的值。 我生成一个循环,为df1的第一列中的每个值计算z得分。但现在我的问题是:如何计算整个数据框的z得分?

test <- list()
for (i in 1:nrow(df1) {
  zscore<- (df1[i,1] - (apply(df2[i,],1,mean))) / (apply(df2[i,],1,sd))
  test[[i]] <- matrix(zscore)
  i <- 1+1
}

谢谢大家!

1 个答案:

答案 0 :(得分:8)

[我认为你这里有行/列。 z分数通常应用于变量,R期望在变量中。我在下面写的内容遵循惯例。如果您真的想按行标准化,请相应更改。]

sweep()是您的一般目的朋友。我们计算均值和标准差,然后从数据框df1中扫描(在这种情况下减去):

## compute column means and sd
mns <- colMeans(df2)     ## rowMeans if by rows
sds <- apply(df2, 2, sd) ## 2 -> 1 if by rows

## Subtract the respective mean from each column
df3 <- sweep(df1, 2, mns, "-")  ## 2 -> 1 if by rows
## Divide by the respective sd
df3 <- sweep(df3, 2, sds, "/")  ## 2 -> 1 if by rows

给出:

R> df3
   V1  V2  V3  V4  V5
1 -30 -30 -30 -30 -30
2 -29 -29 -29 -29 -29
3 -28 -28 -28 -28 -28

我们可以通过以矢量化方式对df3的第一列进行计算来检查这是否有效:

R> (df1[,1] - mean(df2[,1])) / sd(df2[,1])
[1] -30 -29 -28

对于这种特殊情况,还可以使用scale()函数并提供您自己的centerscale,各自的均值和标准偏差

R> scale(df1, center = mns, scale = sds)
      V1  V2  V3  V4  V5
[1,] -30 -30 -30 -30 -30
[2,] -29 -29 -29 -29 -29
[3,] -28 -28 -28 -28 -28
attr(,"scaled:center")
V1 V2 V3 V4 V5 
31 34 37 40 43 
attr(,"scaled:scale")
V1 V2 V3 V4 V5 
 1  1  1  1  1