Question

我正在尝试编译一个 Rcpp 包，目前正在运行 Big Sur（显然是错误的）。我已经按照 here 的指示安装并更新了 Xcode 和 CLANG。但是，在尝试构建时出现以下错误：

ld: warning: directory not found for option '-L/usr/local/gfortran/lib/gcc/x86_64-apple-darwin18/8.2.0'
ld: library not found for -lquadmath
clang-4.0: error: linker command failed with exit code 1 (use -v to see invocation)

这很奇怪，原因有很多；首先，我的 gfortran 目录是 L/usr/local/gfortran/lib/gcc/aarch64-apple-darwin20.2.0/11.0.0。

我的 ~/.R/Makevars 文件是这样设置的：

CC=/usr/local/clang4/bin/clang
CXX=/usr/local/clang4/bin/clang++
CXX1X=/usr/local/clang4/bin/clang++
CXX98=/usr/local/clang4/bin/clang++
CXX11=/usr/local/clang4/bin/clang++
CXX14=/usr/local/clang4/bin/clang++
CXX17=/usr/local/clang4/bin/clang++
LDFLAGS=-L/usr/local/clang4/lib

Answer 1

我将留下一些简短的笔记，作为 ARM 编译问题的答案（有点）。

链接到的帖子有点旧（最新更新 2017 / R 3.4.0），旨在将 OpenMP 合并到旧版本的 R 中。我会确保在今天晚些时候更新它以强调这一点。
重点是使用基于 Intel 的 Mac，因为 ARM 架构（例如 M1 芯片）尚未发布。

话虽如此，我们的注意力现在转向房间里的大象：ARM 和 Big Sur。目前，除了 developer nightlies on the macOS R developer portal 之外，没有 R 和 gfortran 的原生/ARM 编译版本。

这里最好的方法是通过 Rosetta 2 运行 R 和 gfortran（例如使用非本地版本），直到 R 4.1.0 在即将到来的 4 月发布。

更深入的分析，请参见：Will R Work on Apple Silicon?

Answer 2

The Coatless 教授在此处提供了有关 gfortran 和 clang 的更新版本建议： R COMPILER TOOLS FOR RCPP ON MACOS

其中一项更新是他们不再推荐使用 ~/.R/Makevars。

请注意，这仅通过 Catalina (10.15) 解决，尽管它适用于 R 版本 4.y.z（链接的版本适用于 R 3）。理论上，它也可能适用于大苏尔。我还没有找到解决方案，但我在 Intel Mac（不是 M1/ARM）上运行 Big Sur。

为回答而不是评论而道歉，但我还不能评论（太新了）。

在 Big Sur 中编译 Rcpp 包时出现 Clang 错误

2 个答案: