我正在尝试运行基本模型,但似乎管道的插补阶段正在失败,而且我并不十分了解为什么。
这是最小的可复制代码
如果愿意,您可以找到x和y的数据。最初它们在一个公共文件中,我可以轻松地链接到它,但是我对其进行了一些转换,因此我将使用编辑后的输出减少必须阅读的代码。但是,如果需要,我可以轻松链接到原始代码和数据集。
import pandas as pd
import numpy as np
from sklearn.ensemble import RandomForestClassifier,AdaBoostRegressor,AdaBoostClassifier,RandomForestRegressor
from category_encoders import CatBoostEncoder,CountEncoder,TargetEncoder,SumEncoder
from sklearn.preprocessing import OneHotEncoder, StandardScaler
from sklearn.compose import make_column_transformer
from sklearn.pipeline import make_pipeline
from sklearn.impute import SimpleImputer
import datetime as dt
x = pd.read_csv("/home/user/Python Practice/Working/Playstore/x.csv",index_col=("Unnamed: 0"))
y = pd.read_csv("/home/user/Python Practice/Working/Playstore/y.csv",index_col=("Unnamed: 0"))
# Set up Imputers
strat = ["mean","median","most_frequent","constant"]
num_imp = SimpleImputer(strategy=strat[0])
obj_imp = SimpleImputer(strategy=strat[2])
# Set up the scaler
sc = StandardScaler()
# Set up Encoders
cb = CatBoostEncoder()
oh = OneHotEncoder()
# Set up columns
obj = list(x.select_dtypes(include="object"))
num = list(x.select_dtypes(exclude="object"))
cb_col = [i for i in obj if len(x[i].unique())>30]
oh_col = [i for i in obj if len(x[i].unique())<10]
# Col Transformation
col = make_column_transformer((cb,cb_col),
(obj_imp,cb_col),
(oh,oh_col),
(obj_imp,oh_col),
(num_imp,num),
(sc,num))
model = AdaBoostRegressor(random_state=(0))
#Second Pipeline
run = make_pipeline((col),(model))
run.fit(x,y)
print("The score is",run.score(x,y))
模型在.fit
阶段崩溃,并显示错误消息:ValueError: Input contains NaN
。当我估算后,为什么要这样做呢?而我该如何解决呢?
答案 0 :(得分:0)
我正在使用pandas v1.1.3和sklearn v0.23.2。
我猜主要问题是由CatBoostEncoder
引起的。它requires column y as input,因此它可能无法与make_column_transformer()
一起使用,至少不能按照manual的描述进行操作。如固定代码所示,其输出格式也与其他变压器不同。
首先,您的索引混乱了,必须在加载后进行修复。
x.index[10470:10475]
Out[34]: Int64Index([10470, 10471, 10473, 10474, 10475], dtype='int64')
# fix
x.reset_index(drop=True, inplace=True)
y.reset_index(drop=True, inplace=True)
第二,使OneHotEncoder输出密集数组。
oh = OneHotEncoder(sparse=False)
第三,分解管道。
# 1. Impute
x[num] = num_imp.fit_transform(x[num])
x[obj] = obj_imp.fit_transform(x[obj])
assert x.isnull().sum().sum() == 0 # make sure no missing value exists
# 2. Transform
x = pd.concat([pd.DataFrame(sc.fit_transform(x[num])),
cb.fit_transform(x[cb_col], y),
pd.DataFrame(oh.fit_transform(x[oh_col]))
], axis=1)
最后,直接训练和评估模型。形状转换可禁止显示警告。
model = AdaBoostRegressor(random_state=0)
model.fit(x.values, y.values.reshape(-1))
print("The score is", model.score(x, y.values.reshape(-1)))
结果:
The score is 0.6329093797171869
我试图忽略第三方CatBoostEncoder
,而只在所有对象列上使用OneHotEncoder
。
col = make_column_transformer(
(num_imp, num),
(obj_imp, obj),
(sc, num),
(oh, obj),
)
但是,这种尝试以许多我不理解的奇怪方式失败了。
oh
失败,ValueError: Input contains NaN
。sc
失败,发生ValueError: Input contains NaN, infinity or a value too large for dtype('float64').
,只有将x[num]
传递到管道中,并且obj_imp
和oh
被关闭时才会发生。 >
这是我决定放弃管道的主要原因,因为管道中的变压器行为与我在固定代码中观察到的情况大不相同。