如何在foreach中指定R包的位置（...，。package =“pkg”）％dopar％

Question

我的“pkg”安装在其他地方，我怎么能告诉foreach在哪里找到包裹？

foreach(i = 1:2,.packages="pkg") %dopar% { ... }

这给我错误信息：

worker initialization failed: there is no package called 'pkg'

感谢您的帮助。

Answer 1

另一种方法是在致电vmstat 1 2 | tail -3 | sed '2d' 之前将.libPaths分发给所有员工：

foreach

Answer 2

您可以使用.libPaths()函数在正在运行的会话中设置库路径。

否则~/.Renviron等启动文件可以提供帮助，请参阅?Startup。

最后，如果您使用foreach来运行不同的计算机，则需要处理每台计算机上的库路径。

Answer 3

您可以在函数内部指定libPaths

foreach(i = 1:2) %dopar% { .libPaths("your_location_to_pkg") library("pkg") ... }