Question

我正在对Postman中的C3.ai COVID-19 Data Lake运行API调用。我在Subsequence类型上使用Fetch，并且想要获取与Subsequence相关的BiologicalAsset的隔离源。但是我不知道如何正确访问该字段。我在https://api.c3.ai/covid/api/1/subsequence/fetch上运行POST。这是请求正文：

{
    spec: {
        include: "startIndex, endIndex, sequence, sequence.isolationSource",
        limit: 10
    }
}

但是随后生成的XML中的每个对象如下所示：

<k>0</k>
<v>
    <startIndex>1</startIndex>
    <endIndex>182</endIndex>
    <id>LC522350_1-182</id>
    <meta>
        <fetchInclude>[startIndex,endIndex,sequence,id,version]</fetchInclude>
        <fetchType>Subsequence</fetchType>
    </meta>
    <version>1</version>
</v>

这不能正确显示序列或隔离源。我怎么找到这些？

Answer 1

基于API docs，您需要使用“父代”来引用与子序列关联的序列，然后使用该父代的父代来引用BiologicalAsset。那会提出您的要求：

{
    spec: {
        include: "startIndex, endIndex, parent.sequence, parent.parent.isolationSource",
        limit: 10
    }
}

我只是尝试了一下，发现某些子序列没有隔离源。如果只想包含具有隔离源的结果，则可以在规范中添加filter: "exists(parent.parent.isolationSource)"。

如何在C3.ai COVID-19 Data Lake中获取隔离源和子序列的序列？

1 个答案: