在R中使用geom_boxplot（）+ geom_jitter（）时如何排除离群值

Question

我有一个名为mpg的数据集。我有兴趣绘制箱形图（上面带有点），以查看变量drv（动力传动系统的类型）和cty（每加仑城市英里数）之间的关系。 下面是我的代码： ggplot(data=mpg,mapping=aes(x=drv,y=cty))+geom_boxplot(outlier.shape = NA)+geom_jitter()

是否可以从geom_jitter（）中排除异常值？

Plot

Answer 1

您可以使用outlier.shape=NA隐藏geom_boxplot的离群值。对于geom_jitter，您可以使用透明度来隐藏离群值，但是必须首先定义这些离群值。

mpg %>%
  group_by(drv) %>%
  mutate(cty.show = as.numeric(  # so ggplot doesn't complain about alpha being discrete
    between(cty, 
            quantile(cty)[2] - 1.5*IQR(cty),
            quantile(cty)[4] + 1.5*IQR(cty)))) %>% 
  ggplot(aes(drv, cty)) + 
  geom_boxplot(outlier.shape = NA) + 
  geom_jitter(aes(alpha=cty.show), show.legend=FALSE) +
  scale_alpha_continuous(range = c(0, 1)) # otherwise outliers only partially transparent.

对于第二个图，可以根据需要调整y极限。

Answer 2

geom_jitter()没有论据自行丢弃异常值的理由。您需要通过定义哪些点是异常值来手动过滤要绘制的数据点。

library(dplyr)
library(ggplot2)

mpg %>%
  group_by(drv) %>%
  mutate(cty_filtered = case_when(cty - quantile(cty)[4] > 1.5*IQR(cty) ~ NA_real_,
                                  quantile(cty)[2] - cty > 1.5*IQR(cty) ~ NA_real_,
                                  TRUE ~ cty)) %>%
  ggplot() + geom_boxplot(aes(drv, cty)) + geom_jitter(aes(drv, cty_filtered))